肾结石的治疗需要根据结石的部位、数目、大小、肾功能、是否合并解剖异常、是否合并感染、以及身体状态等情况来制定。一般来说，5mm以下的肾结石，以保守治疗或观察为主。5mm~2cm的肾结石，首选体外碎石。2cm以上的肾结石首选经皮肾镜取石，如果结石比较多可以考虑开放手术取石。
肾结石可以做碎石术，但不是全部都要做手术，而是要到泌尿外科做CT。
肾结石比较小，6mm以下，一般不需做外科手术，建议多饮水、多排尿、多做运动、多做一些保守的处理，同时还可以服用一些通淋利湿的中成药物，比如：金钱草颗粒，肾石通片等。
肾脏结石1厘米处无肾积水，可以通过体外震波碎石，达到良好的治疗目的，但肾结石直径1厘米以上，出现肾盂积水时，可以通过输尿管软镜钬激光碎石，或经皮肾镜碎石。
对于肾脏结石能否进行碎石，需要结合患者的情况进行详细的检查，主要有：体外震波碎石和外科碎石。
如果患者的结石很小，例如肾结石，直径在6mm以内，那么大多数患者都不会用到碎石，一般情况下，6mm以内的结石都能自行清除。结石的大小超过6mm，小于2cm，通常情况下，阻塞并不是很严重，可以采用体外碎石术进行处理，排除体内的结石；而结石的大小超过2公分，结石堵塞程度较高，则需采用外科碎石。
通常情况下，肾结石碎石后可以吃饭。具体情况分析如下：
一般肾结石可以选择体外冲击波碎石，碎石后会出现血尿、腰痛、恶心等不适症状，碎石后结石内的细菌等成分会暴露于尿液中。因此，应大量饮水，口服排石药物，增加尿液分泌，促进结石排出。同时建议饮食均衡，补充能量，增强抵抗力。因此，肾结石患者体外碎石后可以进食，饮食要均衡。
一般情况下，肾结石碎石后需要休息多久需根据实际情况来判断，具体内容如下：
肾结石的恢复和手术创伤的大小有很大的影响。要是做了体外碎石的话，可以在当天出院，如果工作不用那么辛苦，明天就能继续工作。工作很辛苦的话，可以休息3到7天。肾镜下的碎石取石术，在腰间做了一个瘘口引流，需要一个月的休养。输尿管软镜钬激光碎石取石术需要休息一个多星期。