一般情况下，患有慢性肠炎，可以采用药物治疗、生活护理等。
如果患有慢性肠炎，可以在医生的指导下使用药物进行治疗，如乳酸菌素片、苦参胶囊、盐酸米诺环素胶囊等，有利于缓解相关症状，促进身体恢复正常。在日常生活中，患者需要养成良好的生活习惯，注意休息，避免熬夜和过度劳累，适量吃蛋白含量丰富、易消化的食物。
小儿慢性肠炎多位于胃肠道部位，可能是脾胃虚弱所致。
慢性肠炎分为细菌性感染和真菌性感染，患病情况下建议在医生的指导下使用合适且敏感的抗生素药物进行治疗，如果效果不显著，建议及时去医院就诊，可以进行尿便常规的检查，明确病因后再对症治疗。治病期间，建议患者选择清淡易消化的食物进行食用，少吃辛辣刺激的食物，以免加重肠胃的不适，加重病情的发展，多注意休息，适当进行户外运动，加强身体免疫力。
慢性肠炎是细菌，病毒，真菌或寄生虫引起的小肠和结肠的炎症。表现为腹痛，腹泻，稀水样便或粘液脓血便。小儿肠炎多因不洁东西所引起，故预防最要紧的是食物之清洁及保存安全。
除了吃药以外，慢性肠炎是很难治疗好的，时间会拖得很长。还要注意在饮食上注意多吃清淡有营养的食物，腹泻的病人不宜吃。鸡蛋，注意饮食卫生。清淡饮食，多吃新鲜蔬菜水果，多喝水，忌辛辣食物。
小孩子得了结肠炎主要是腹痛腹泻等，这是一种常见的疾病给孩子做一个大便常规检查一下，然后给孩子喂点适当的肠胃药物，平时应该以清淡饮食为主，多给孩子喂点水，观察一下孩子精神状态。
应减少喂奶量和延长喂奶间隔时间，暂停或减少辅食。人工喂养者可暂给稀释乳、米汤等易消化食物，然后逐渐增加乳量。注意观察呕吐及腹泻物的性质并记录次数和量以及排尿时间和尿量。勤换尿布、勤洗臀部，预防尿路感染和尿布性皮炎。