临床症状有疼痛和血尿是输尿管结石的主要临床症状。可以出现突发性的腰腹部剧烈疼痛，呈阵发性的绞痛，疼痛非常难忍，可以放射到下腹部或者阴囊、阴唇、大腿内侧等。
输尿管结石在泌尿外科来说是比较常见的一个疾病，主要症状一般是以肾绞痛为主要表现，往往是突然发生肾区绞痛，而且疼痛是十分剧烈难以忍受，往往会向四周放射，比如放射会阴区，还有就是男性可以放射的睾丸、阴茎，女性可以放射到阴唇，还有就是伴随着有恶心、呕吐的症状。
输尿管结石都与肾结石的症状很相同。输尿管结石分为两个部分，在中上段的结石主要能引起一侧腰部疼痛与小便伴有血丝。而输尿管膀胱壁段结石是引起尿频、尿急、杘痌主要凶手之一，同时还会引起同侧肾积水和感染。对于输尿管结石治疗患者可以选择对症治疗、体外震波碎石、中药治疗与经内窥镜摘石、手术取石等。
当输尿管结石引起急性肾绞痛时，主要表现为患侧腹痛。疼痛的性质是绞痛、隐痛或钝痛，疼痛辐射到腰部、腹股沟、腹部、会阴等部位，出现血尿；多数情况下会伴有腹胀、恶心、呕吐等症状。临床上也有单纯的血尿症状。一些大结石通常不显示肾绞痛。体检是发现肾结石最常用的方法。
疼痛为最常见症状，疼痛通常为突然发生，并在短时间内发展至剧烈程度，表现为剧烈的放射性绞痛，绞痛呈阵发性发作并加重，并伴大汗、面色苍白、血压下降、心悸脉速等休克症状。
输尿管结石症状有约90%会出现疼痛、还有血尿、膀胱刺激征，烦躁不安，在床上翻滚，不能安静平卧，通常表现为镜下血尿，部分有肉眼血尿。输尿管膀胱壁段结石可引起尿频、尿急、尿痛等症状。