慢性自身免疫性甲状腺炎可以通过口服药物进行治疗。慢性自身免疫性甲状腺炎是很常见的一种甲状腺疾病，发病机制是由于体内免疫系统异常导致甲状腺出现问题。
甲状腺炎怎么治，要看甲状腺炎种类及甲状腺功能。
一般除了急性甲状腺炎要用抗生素外，其他甲状腺炎不需抗生素治疗。甲亢病人一般不需抗甲亢药，但有少数病人需长期用药。甲状腺功能恢复正常，没有明显的压迫症状，一般可随诊随看，不需处理。当发现有严重压迫症状时，应及时进行手术切除。如增大的甲状腺对邻近器官有压迫作用，也可影响外形，可以吃激素类药物，让腺体变小。如果患者有慢性活动后乏力或疲劳等表现时，应考虑是否患有甲状腺疾病，并及时就医检查，以明确诊断及选择合理治疗方法。普通甲状腺炎所致甲状腺机能亢进无需手术及碘-131。
甲状腺炎的治疗要根据病情轻重来进行治疗。
如果是轻度的甲状腺炎，如果没有症状，可以暂时不治疗，通常能够靠自身免疫得到治自愈。亚急性甲状腺炎需要对症治疗，减轻炎症反应，减轻疼痛。若是无痛性甲状腺炎需要及时治疗，避免病情加重，危害到患者的身体健康。此时患者可在医生指导下使用阿莫西林胶囊、阿奇霉素片等药物进行治疗。
甲状腺炎多由于细菌，真菌以及邻近周围器官炎症蔓延引起，早期表现为红，肿，热，痛需给予抗菌素治疗。甲状腺炎早期表现为甲亢等高代谢症候群，多采取对症治疗，如发烧给予解热镇痛治疗，甲亢症状给予β受体阻滞剂治疗。病情较重，病程较长者，给予糖皮质激素进行治疗，但不作为首选。甲状腺炎症性疾病，均可进行结合治疗，通过改善甲状腺激素分泌，促进甲状腺功能恢复。
甲状腺炎的种类较多，其治疗需要对症处理，主要有以下几种方法：
1、急性甲状腺炎：因为细菌感染，局部的甲状腺化脓，伴有发烧，以消炎治疗为主，如果有化脓，可以局部切开引流；
2、亚甲炎：往往继发于病毒感冒以后，典型的症状是甲状腺或颈部的疼痛，伴有发热，严重的患者可以采用激素治疗，但是对于一般的患者，不采用激素治疗，对于发热超过38.5℃以上的患者可以进行退烧，疼痛的患者可以用止疼药治疗，在亚甲炎的治疗上，中医治疗比较有优势，可以在早期使用清热解毒的中药治疗，对病情的缓解有明显的益处。