一般情况下，肥厚型心肌病的患者生存期长短不一，有长期也有短期。具体分析如下：
通常，成年患者在10年内无任何征兆，直至心力衰竭。这种疾病是青少年和体育选手中最容易发生的心脏病，一般都有家族遗传史，而倍他乐克等是治疗肥大性梗阻性心肌病的主要选择，如果药物不能有效，可以选择乙醇肥厚室间隔消融或者起搏法等。
肥厚性心肌病的预后有较大的不同。
对梗阻性肥厚性心肌病（简称梗阻性心肌病），部分于青少年时期及活动期间突然死亡，部分逐渐发生心力衰竭（心衰），进展至终末期心衰（心衰），最终死于心力衰竭，感染及其他疾病。而部分病人（以非梗阻型肥厚性心肌病为主），临床表现较轻，大多在平时健康查体中被检出，对一般日常活动无影响，临床症状较轻，寿命与正常人相近。
肥厚型心肌病是以心肌肥厚为特征，为呼吸困难，劳力性呼吸困难，严重呈端坐呼吸或阵发性夜间呼吸困难。还可能诱发心绞痛，常有典型心绞痛，劳力后发作。肥厚型心肌病发展缓慢，会发作心律失常，需要积极的营养心肌治疗，预后则可以。
肥厚型心肌病的患者预期生命差别很大，与是否有流出道梗阻，是否进行及时治疗，以及患者对治疗的反应是否较好等许多因素有关。如果不及时治疗，部分梗阻性肥厚型心肌病的患者，可能会发生青少年猝死。经过治疗的梗阻性肥厚型心肌病的患者，可以活到中年甚至中年以上。对治疗反应非常好的非梗阻性患者，寿命可能接近正常人。
是可以治疗好的。肥厚性阻塞性疾病具有较高的猝死率，尤其是在青少年运动时，大多发生在20岁左右。有的出现心力衰竭等症状，如果没有较好的治疗，药物治疗反应差，将在1到2年内死亡。如果患者术后效果较好，则优于正常人。
肥厚梗阻性心肌病是比较严重的，对于梗阻性肥厚性心肌病病人，有的在青少年时以及运动中猝死，也有一部分逐渐出现心力衰竭，发展为终末期心衰，最后因心力衰竭、感染等原因死亡。但也有一部分病人，主要是非梗阻型肥厚性心肌病病人，临床表现轻微，多数在正常健康查体时发现，不影响一般的日常活动，临床症状轻微，寿命接近正常人。