开始治疗的年龄越小，效果越好。可根据儿童的年龄和消化能力多吃油脂食品，如肥肉、芝麻酱、糖果及甜食等。无机盐和维生素应充足。在调配饮食时尽量做到食品多样化。多吃新鲜蔬菜和水果。至于寿命长短因人而异。寿命长短跟治疗情况病人的体质等有关。
一般是需要在苯丙酮尿症出结果后的2天-3天复查，正常人血中苯丙氨酸浓度为1—3mg/dl，而苯丙酮尿症一般孩子出生后会进行筛查，患者血苯丙氨酸可高达20mg/dl以上.新生儿苯丙酮尿症一般孩子出生后会进行筛查。
苯丙酮尿症一般可以血苯丙氨酸测定来确诊。
染色体异常可能会导致苯丙氨酸代谢途径中酶缺乏，导致苯丙氨酸及酮酸在体内蓄积，造成苯丙酮尿症。苯丙酮尿症一般可以进行血苯丙氨酸测定来确诊，采集通新生儿的足跟末梢血，进行苯丙氨酸浓度测定，血液中苯丙氨酸浓度超过120mmol\L，可能提示新生儿患有苯丙酮尿症，一般会出现生长及智力发育迟缓、抽搐、反射亢进等症状。
新生儿苯丙酮尿症可以造成小孩智力发育低下，但未必是一定会造成智力低下，苯丙酮尿症是苯丙氨酸中某种酶缺乏，属于染色体类疾病，须进一步检查和确诊，一旦确诊应立即治疗。
神经精神表现，表现为智力低下、容易兴奋、多动、孤僻、惊厥、肌张力增高、腱反射亢进等。皮肤毛发表现，由于黑色素合成障碍，导致患儿皮肤白、头发黄，部分患儿容易出现湿疹。其他、由于苯丙氨酸代谢异常导致代谢产物苯乙酸增多，从尿液中排出而有鼠尿味。确诊疾病，尽早积极治疗，可以通过饮食疗法以及药物治疗的方法治疗。尽早治疗，可以观察病程变化，选择合理的治疗方法。