肠菌群失调的症状有胃肠不适和全身症状。
肠道中有着各种各样的细菌，有些是对身体有利的，有些是有害的，这些细菌相互克制，保持着一个均衡的状态，所以身体并没有出现任何的不适。如果是因为使用了抗生素等，导致细菌数量增加或者降低，可能会菌群失调，进而可能会导致腹胀、拉肚子、便秘等胃肠不适症状，也可能会导致脱水和反复的口腔溃疡等全身症状。如果出现肠道菌群紊乱，建议在医生的指导下口服益生菌、二联活菌等可以帮助消化的药物。
妇科菌群失调的症状有:外阴瘙痒：夜间尤甚，甚至影响夜睡眠；阴道炎症：感觉烧灼痛，特别是排尿后；性生活：性交痛，包括尿痛。因阴道黏膜损伤，排尿时烧灼疼痛明显。部分患者阴道分泌物增多，类似豆腐渣。
女性阴道菌群失调的症状有可能会出现外阴剧烈的瘙痒感，有可能会出现白带粘稠，有可能会出现黏膜红肿的情况。要到医院做一个白带常规检查，明确身体内的病情以后再治疗。
阴道菌群失调可导致阴道炎，出血外阴瘙痒、白带异常等。引起阴道菌群失调的原因有平时用妇科洗剂过多，破坏了阴道的弱酸性环境；服用大量抗生素也可导致阴道菌群失调。要相信科学，不要乱吃、乱用药。
肛瘘的症状是会排脓，脓汁粘稠，黄色、味臭；瘘管日久的排脓相对较少，或时有时无，稀淡如水；若脓量增加，则表示新瘘管生成瘘管有时会暂时封闭，不排脓液，从而出现局部肿痛，体温上升。
