一般来说，宝宝肛瘘不会自愈，具体分析如下：
宝宝肛瘘主要是肛周脓肿不能及时的处理，或是经常复发导致的。大多数儿童可以用温生理盐水坐浴，也可以用高锰酸钾稀释液来缓解，但并不能根治，必须进行外科手术。挂线是肛瘘外科最常用的外科方法，它既简便又有效。因此，肛瘘通常不会自行愈合。
在日常生活中，家长应该加强孩子的营养摄入，保持睡眠充足，早睡早起适当参加户外活动，有助于健康成长。
肛肠科咨询一下，如果轻，坐浴可以用来消肿止痛。急性发作期可以使用抗生素，但一般不要超过7天。如果比较严重，还是建议手术治疗，通过手术将瘘管全部切开，必要时将瘘管周围瘢痕组织同时切除。
婴幼儿是不会痔瘘疾病的，但肛瘘是个例外，婴幼儿肛瘘90%以上发生在1岁以下，特别是男婴。因男性直肠皱壁深，粪便易积存，加之母乳喂养粪便稀软，排便次数多，因而母乳喂养的婴儿比人工喂养的婴儿肛瘘的机会要多。
肛瘘不能自己康复，肛瘘是肛周脓肿破溃以后形成的疾病，主要构成是内口，外口和瘘管，其中瘘管是一个坚硬的结缔组织管道，是不会自己康复的。只能通过手术将瘘管切除，内口敞开才能康复。
肛瘘是肛腺感染化脓引起的，绝大部分都需要手术治疗，不能自愈。因为脓肿虽然破溃或已切开引流，但原发感染源如肛窦炎、或肛腺感染依然存在，肠腔内容物还可从内口继续进入瘘管;肛瘘的治疗可以采用瘘管切开术，肛瘘切除术，或者可以用中医的挂线疗法。
婴儿的肛瘘一般是不能够自愈的。婴儿肛瘘多为低位单纯性肛瘘，具有一定的自愈性，但是也需要配合药物处理的，需要三周以上的时间，而且应该注意调理好婴儿的肠道功能，避免腹泻或者是便秘。