肩袖损伤手术后，很容易导致肩袖韧带损伤，粘连周围的软组织，在刀口内部可能会出现瘢痕挛缩，产生持久的疼痛。
如果病人在术后，不注意肩关节部位的功能锻炼，很容易导致组织粘连挛缩，瘢痕挛缩，局部出现无菌性炎症，导致肩关节疼痛。而且在活动肩关节的时候，牵拉粘连挛缩组织，会加重疼痛。这种疼痛会持续很长时间，需要进行肩关节功能锻炼，将粘连软骨组织拉开，疤痕软化后疼痛才会消失。
肩袖损伤夜间疼痛剧烈多是因为长期劳损或是外伤导致的肩关节周围肌腱肌肉软组织的无菌性损伤，一般有局部疼痛，活动受限的情况严重影响生活质量，早期给予热敷理疗、针灸、适度的推拿按摩，可改善症状。
有些病人做完手术都没有疼痛，早期都感觉只有一些酸胀感，疼痛不明显，但是个别病人张力非常高，他痛的时间会比较久，有的时候三个月，最长的病人有半年左右的时间，所以疼痛因人而异，时间长短不一。
一般情况下，肩袖损伤不会一直疼。
轻微的肩袖肌肉损伤可以通过肩部的制动，休息，用前臂悬吊固定5-7天后，炎症水肿会慢慢消退，疼痛也会减轻。患者还可以进行肩部的功能训练，这样可以使肩部的运动能力恢复到原来的水平，不再有任何的痛楚。肩袖撕裂，要做肩关节镜手术，不然会留下病变，持续疼痛，一般要恢复3-4个星期，彻底痊愈后不会再疼痛。
肩袖损伤疼痛的临床表现是静息痛和活动痛。肩关节损伤的疼痛有其特殊性。首先是由于肩部受到冲击而产生的疼痛。对病人的生活有很大的影响，如拿东西、穿上衣、晾衣服、乘公共汽车等都会给病人带来不便。其次，关节的活动性不会受到太大的影响，可以进行一些被动的运动，但因为疼痛，大部分人都不想做运动，长期下来，会影响到关节的灵活性。肩袖损伤要做好核磁共振检查，了解其损伤的严重程度，从而制定相应的治疗方案。
肩袖的功能是上臂外展过程中使肱骨头向关节盂方向拉近，维持肱骨头与关节盂的正常支点关节。肩袖损伤将减弱甚至丧失这一功能，严重影响上肢外展功能。如果损伤较重、肩袖完全撕裂，或经保守治疗3～6个月效果不好，需行手术治疗。会有一些手术后遗症留下。