百日咳一般采用抗生素进行治疗。治疗百日咳的方法一般分有三种：
1、针对百日咳杆菌进行病原学的治疗，可以选用大环内酯类药物进行治疗，一般要在2-3周左右。
2、对症支持治疗，可以口服止咳化痰类的中成药或西药，配合雾化吸入治疗，减少呼吸道炎症反应，缓解痉挛性咳嗽。
3、饮食方面要注意饮食，多吃容易消化、高热量的食物。
百日咳的症状是咳嗽，有时候有鼻塞、流鼻涕、打喷嚏，或者是发烧的症状。嗽主要是夜间为主，尤其下半夜，发作前没有特殊的表现，在咳嗽的过程中还伴有特殊的吸气性吼声。还会出现口唇发青、喘憋的症状。
类百日咳的症状是初期一周出现轻咳，约一周后进入痉咳期，咳嗽的非常剧烈，振发性、痉挛性的咳嗽，不咳嗽时一样能吃能喝，咳嗽就会连着咳很多声，甚至咳几分钟。夜间睡着都会咳醒，好像有很多痰，但痰也咳不出来，脸憋得通红，甚至脸色发紫，咳完后有时候出现像尖叫一样的尾声。
婴儿百日咳的常见症状有阵发性痉挛性咳嗽，伴有吸气时鸡鸣样的回声，刚开始的症状和感冒相似，伴有鼻塞，流涕，轻咳，低热等，剧烈咳嗽时会出现呼吸困难。因为该病情总病程2～3个月，因此称之为百日咳。
百日咳会表现为剧烈的咳嗽，由于咳嗽的频率高，非常剧烈，病人往往会咳得面红耳赤，常常会把眼泪鼻涕一起咳出来。由于在发病的时候，吸气过猛，常常会伴有像鸡叫样吸气性吼声，如果未得到有效治疗，一日可以发作三四十次，病情可达数个月。病人往往以夜间发病最为明显，年龄愈小，病情愈重。
小儿百日咳的医治方法可以使用雾化吸入医治，能够医治小儿百日咳，百日咳是由于时间咳嗽太长，也是过敏性咳嗽，服用一些抗过敏类的药物，进行止咳医治效果也是比较好的。