宝宝嗓子疱疹反复发热，可以通过予物理降温、服用退热药物、服用抗病毒药物等方式处理。具体分析如下：
宝宝嗓子疱疹反复发烧有可能是得了手足口病，主要是由病毒感染引起的。如果发热不超过38.5度，可予物理降温，反之可服用布洛芬混悬液之类的退热药物。
宝宝嗓子疱疹反复发热还有可能是疱疹性口腔炎，需要保持口腔清洁，多饮水，可服用抗病毒药物治疗。
考虑有合并细菌感染，需要查个血常规CRP，炎症高需要进行抗病毒，退烧输液治疗。孩子咽喉部起疱疹，是疱疹性咽颊炎，属于病毒性感染，可以出现高烧，咽喉肿痛，疱疹破溃后可能并发细菌感染。此病有传染性，注意预防避免交叉传染。
考虑疱疹性咽峡炎由于病毒感染引起的，病程在一周到十天左右。需要在指导下口服药物，会反复发烧几天的，反复发烧是由于病原微生物没有完全消灭所致，这种继续配合治疗。
疱疹性咽峡炎多是由柯萨奇病毒A引起，表现为明显的咽痛、发热，病程大概有一周左右的时间，查体可以看见咽部明显充血，软腭、腭垂、咽以及扁桃体表面上有灰白色疱疹及浅表的溃疡，周围同时伴有红晕。
考虑合并有细菌感染，口腔疱疹主要是由于肠道病毒，尤其是柯萨奇病毒、EV71病毒多见。部分孩子也会出现混合感染，出现发热、口腔疱疹，手足可见红色皮疹，后期可出现指甲、趾甲脱落等情况。治疗上需要服用抗病毒消炎类的药物治疗。
儿童口腔疱疹，通常认为由病毒感染所致，但是必须与手足口病加以鉴别。如果宝宝口腔出现疱疹，那么很可能是由于病毒侵犯到了口腔粘膜组织而导致。婴儿口腔疱疹可应用抗病毒药物治疗，亦可用双黄连、清热解毒之药，如板蓝根。如果出现皮疹或口腔溃疡等症状时，可选用红霉素、阿奇霉素等抗生素类药物治疗。当婴儿体温高于38.5°C时，可使用美林之类的退热药。家长不要给患儿服用含酒精的药物，以免加重病情或造成不良反应。
此外，家长应该重视儿童口腔卫生，维持其口腔清洁，每日可用淡盐水为孩子含漱，减轻儿童咽部及口腔不适。