会引起局部的疼痛，会压迫到神经引起麻木，也会出现关节活动时的卡顿感。可以通过手术切除囊肿的部位，也可以结合推拿针灸治疗，平时注意适当的活动关节，不要长时间机械性单一性的活动。
通常来说，腱鞘囊肿抽液很疼，具体分析如下：
腱鞘囊肿在抽取液体的过程中不会感觉到疼痛。刺痛感是从刺入囊肿的皮肤开始的，因为皮肤上有浅表神经和血管，所以在穿刺的时候会感到疼痛，但是在穿刺的过程中并不会感到疼痛。而且，如果将囊肿中的凝胶状物质抽出，也不会感到任何的痛苦，因为囊中没有任何的神经分布。在拔出针头的过程中，也不会有明显的疼痛。
当脚背的腱鞘囊肿较小的时候，通常没有临床表现，患者常常容易忽略，不易发现。
当囊肿变得越来越大，对周边的细胞造成压力时，病人会出现局部的肿块，只有在少量的时候，病人会感到疼痛和麻痹。如果没有明显的临床表现，不会对患者的生命造成任何的伤害，也可以先不治疗，只需要进行常规的追踪。当囊肿变大时，会出现局部疼痛、肿胀、局部皮肤发麻等症状时，建议做外科手术，彻底的将囊壁完全切除。
一般情况下，当腱鞘囊肿处于浅表位置，且囊壁较薄时，可以通过挤压使其破裂，这种情况下，腱鞘囊肿挤破并不疼。但是对一些深层的腱鞘囊肿，且囊壁比较厚时，挤压时就会伴有明显疼痛，而且不容易挤破。所以一般并不推荐采取挤压的方式来治疗腱鞘囊肿，患者可以通过腱鞘囊肿切除手术进行治疗，并且该手术也是一种非常简单的手术，术后复发的概率非常小。
对腱鞘囊肿多数病例无需特殊处理，由于腱鞘囊肿并没有造成明显症状，所以主动注意休息即可。
切忌局部反复按摩推拿，否则可能会导致腱鞘囊肿渐渐变大，造成疼痛症状时，特不必封闭针治疗。可通过手指将其挤出或手术取出。若做打封闭针治疗，麻醉时有一点疼，麻醉后也没有疼的感觉。打封闭针时要做好消毒处理，避免因为穿刺引起感染，在打针后要注意休息，避免打针处过多的活动。在打针后观察1周的时间，如仍有疼痛感，可进行第二针的注射。
指尖发生腱鞘囊肿，并有明显痛苦，首先，应主动了解是否为腱鞘囊肿，多数病例腱鞘囊肿不发生于直接处。
指尖腱鞘囊肿很疼，如果发现是比较大的腱鞘囊肿就需要及时到医院进行确诊和治疗，因为这是一种较为常见的病症。还可表现为局部血管瘤，此种情况可主动手术切除，再做病理检查，依据病理检查结果，再次采取相应处理措施。