3个月的婴儿睡觉老是摇头可能是湿疹、佝偻病等原因导致的，需要可以对症治疗，具体内容如下：
1.湿疹：如果婴儿头部出现湿疹，可能会引起局部瘙痒，婴儿可能会通过摇头的方式缓解局部瘙痒的症状，从而出现3个月的婴儿睡觉老是摇头的情况。可以在医生的指导下使用维生素B6软膏、醋酸地塞米松乳膏、维生素C片等药物进行治疗，还可以使用硼酸溶液进行冷敷。
2.缺钙：由于缺乏维生素D或钙元素，影响脑神经系统的发育，容易出现3个月的婴儿睡觉老是摇头的情况，婴儿可以吃富含维生素D的食物，如鸡蛋羹、牛奶等。
婴儿摇头的原因是多种多样的，首先可能跟孩子的大脑前庭发育有关系，对于身体的控制不完善，就容易出现摇头晃脑的表现，但都是暂时性的。或者宝宝存在中耳炎的表现，耳朵疼痛，但是又不懂得如何表达，也会出现摇头的症状。如果宝宝的湿疹比较严重，出现瘙痒的时候，也会用摇头来表达自己的不适。这几个原因当中，中耳炎是最主要的，一旦发现一定要积极治疗。
通常来说，婴儿老是摇头可能是多种原因导致的，具体分析如下：
首先，可能是由于维生素D不足引起的。维生素D缺乏性佝偻病是婴幼儿常见的疾病，主要是因为缺少阳光，长时间的拉肚子，以及营养不良。初期的症状主要有夜间盗汗、夜惊、烦躁、摇头等，多见于6个月以内的婴幼儿。如果不及时治疗，可能会发展为方颅畸形、手镯足镯畸形等。
如果是刚出生的宝宝，神经系统发育不完善，可能会出现无意识的摇头随着宝宝年龄增大，发育完善会好转。如果宝宝睡觉的时候总是摇头，同时伴随头部出汗多，可能是宝宝有缺钙的表现，头皮痒，宝宝会通过摇头的方式来缓解头部瘙痒，长时间会形成枕秃，需要给宝宝进行补钙补充维生素d治疗。
先考虑的是不是室内温度过高，导致孩子睡觉不舒服，或者考虑孩子是不是有缺钙的情况，所以经常左右摇头，可以带孩子到医院做关于微量元素的检查进行确诊，一般适量的给孩子添加辅食，多晒太阳，保证正常的摄入量，以免影响正常发育。
抽动症摇头没有好的治疗方法，只能慢慢恢复。通常可以自行恢复。但要排除小舞蹈症、肝豆状核变性、癫痫性肌阵挛等脑器质性疾病引起的抽动。要注意孩子的情绪，保持平和，避免消极的心理，鼓励孩子克服并减少抽动的症状。平时可以给宝宝进行一些按摩处理，有利于减缓症状，在饮食方面可以多补充一些鱼类，动物的脑，骨髓等。