尿痛流脓多见于尿道特意感染，如果既往有不洁性交史，初步考虑淋菌性尿道炎，可以到医院泌尿外科就诊，进行分泌物化验，如果是革兰阴性杆菌阳性，可以明确诊断。确诊后应该禁欲、抗生素输液治疗。
阴茎尿道口流脓还尿痛需要检查是否尿路感染导致的症状。泌尿系感染会伴有尿频、尿急及尿痛等尿道刺激症状，上尿路感染者可有发热的全身不适，但下尿路感染可能缺乏全身表现，阴茎肿大可能是炎症刺激阴茎血管扩张充血所致。
尿痛是指排尿时或排尿后耻骨上区或尿道内烧灼样，针刺样痛感，与尿频，尿急合称为膀胱刺激征。病因多见于膀胱，尿道炎症或结石。病变刺激膀胱及尿道粘膜和深层组织，引起膀胱、尿道痉挛及神经性反射。排尿初痛多见于尿道炎，而膀胱炎为排尿中或排尿后痛。注意观察尿道口是否有脓性分泌物。通常需要口服抗生素进行治疗的。
阴茎流脓尿痛尿里有白丝考虑就是淋病，是由于不洁的性接触感染淋球菌引起的一种性传播疾病，可以通过尿常规，尿道分泌物，脓液的培养诊断，治疗淋病的办法是静脉使用抗生素，一周左右能够康复。
阴茎拉尿痛而且流绿色液体应该是尿路感染引起的尿道炎和龟头炎。可以服用一些消炎药。应去医院进一步检查。不要吃辛辣食品，多喝水有冲洗尿道的作用。注意自己的个人卫生。不要同房。