肾结石的治疗需要根据结石的部位、数目、大小、肾功能、是否合并解剖异常、是否合并感染、以及身体状态等情况来制定。一般来说，5mm以下的肾结石，以保守治疗或观察为主。5mm~2cm的肾结石，首选体外碎石。2cm以上的肾结石首选经皮肾镜取石，如果结石比较多可以考虑开放手术取石。
肾结石碎石后就会变得特别小，会通过输尿管尿道才会排出身体外，而且还不会对身体有的影响，通过碎石以后一定要适当的多喝水，另外可以服用中药.中药可有清利湿热通淋排石的作用.结合西药效果更好.可解痉扩张输尿管有利于石头排出.。
儿童肾结石需不需要碎石，要看其大小。
肾石通颗粒、排石颗粒等可用于0.6以内的肾结石治疗，肾结石在超过0.6的情况下，可选用体外冲击波碎石，超过2.0的患者要做外科治疗。肾结石的发生与饮水少、尿液浓缩有关，如果出现肾结石的情况，一定要避免在口渴后喝水，因为干渴属于高张性脱水，需要在没有口渴的情况下补充水分。
要注意适当的补钙，适当运动，多吃黑木耳。
肾结石可以做碎石术，但不是全部都要做手术，而是要到泌尿外科做CT。
肾结石比较小，6mm以下，一般不需做外科手术，建议多饮水、多排尿、多做运动、多做一些保守的处理，同时还可以服用一些通淋利湿的中成药物，比如：金钱草颗粒，肾石通片等。
肾脏结石1厘米处无肾积水，可以通过体外震波碎石，达到良好的治疗目的，但肾结石直径1厘米以上，出现肾盂积水时，可以通过输尿管软镜钬激光碎石，或经皮肾镜碎石。
肾结石可以采用碎石术进行治疗。治疗的目标是清除结石，维持泌尿系统的畅通，对于体积较小的结石，可以采用体外震波碎石。
对于5~2cm的结石，可以采用体外震波碎石。在日常生活中要多吃易消化的食物，不要过量的食用高蛋白、高嘌呤、高钙的食物。日常生活中要注意少吃多餐，戒烟戒酒。可以多吃西瓜、苹果、梨、香蕉等水果，这些水果含有丰富的水分，可以通过多排尿来促进结石排出。