肾结石长期不除根会有危害，具体分析如下：
如果结石存在的时间过长，可能会引起尿道粘膜溃破出血，或者是细菌侵入粘膜，会出现腰痛、发热、尿频尿急等症状。如果结石反复与粘膜摩擦，会引起粘膜出血，并且会出现反复的血尿。结石会刺激粘膜，引起粘膜不典型增生，从而引发上皮癌。如果结石不能及时排出，则会造成阻塞，严重者可发生尿毒症、脓毒血症等。
肾结石会不会有长期的隐血，要看患者的情况。
如果发现了隐血，这是一种很普遍的症状，这是由于肾结石与肾脏产生了摩擦，引起了某些黏膜的血管爆裂，患者的尿液中有血，如果做了尿常规检查，就会发现有隐血。一般情况下，这些患者并不会受到太大的伤害，也不会对患者造成太大的伤害，但是也有少数患者会出现贫血，尤其是在剧烈的运动中，还有的患者会长期的存在，尤其是肾结石的患者。
检查出来得了肾结石是积极的治疗。如果没有任何不舒服的症状，结石也不大，可以适当的服用点排石的药物，多做蹦跳等运动；如果结石比较大，肾结石的形成与的体质、饮食习惯有关，大部分是钙质的沉积导致的，而喝酒是不会导致肾结石加重的。
危害是会引起结石越来越大，会影响到工作，非常难忍的，所以还是要积极的诊疗一下，肾结石，诊疗方法是，每天多喝水，然后进行体育锻炼，不要久坐，不要吃豆腐和菠菜，不要喝水质不好的水。
长期喝碳酸饮料不会得肾结石，碳酸饮料摄入与肾结石的发生是正相关的，目前仍无任何研究可以证明两者存在明确的因果关系。虽然喝碳酸饮料并不能直接导致肾结石，但是其中含有的大量糖分、碳酸在长期大量饮用下会导致糖分摄入过量，患上糖尿病，并且会使尿液中的钙离子浓度增加，草酸含量大大提升。