治疗慢性附睾炎一般可以进行药物治疗、手术治疗。
1.药物治疗：慢性附睾炎主要是由于急性附睾炎没有完全根治，并且经常复发。慢性附睾炎的临床表现比较轻微，检查时会发现附睾部位有硬结，局部有压痛感，附睾不平滑，精索可能会变得更粗，此时可以口服敏感的抗生素，多喝一些水，这样可以有效的缓解病情。
2.手术治疗：但是，如果复发或者是抗感染的药物无效，可以选择手术摘除。
西医治疗一般采用抗生素治疗，效果并不理想，附睾手术切除对身体的损害较大。可以选择中医药物治疗，如：中药口服，局部热敷治疗，中药坐浴，抬高阴囊等。同时注意避免诱发和加重的因素，如房事过度、长时间坐骑等，按医嘱用药，坚持疗程治疗。
治疗慢性附睾炎目前并无明确的治疗方案，慢性附睾炎单纯应用抗菌药物效果不一定理想。若有慢性男性同志的前列腺炎，必须同时进行治疗。同时应重视男性同志的前列腺的综合治疗。抬高阴囊、局部热敷、热水坐浴等。
性生活节制规律，注意休息，避免熬夜，适当的进行体育锻炼，避免饮酒以及进食辛辣等刺激性食物。适当的吃一些消炎药进行缓解，如果太严重，要去医院做个详细的检查，进行治疗。
朋友患有慢性附睾炎，主要是由于急性附睾炎治疗不彻底，通常伴有慢性前列腺炎。可口服抗生素和治疗前列腺炎的药物。平时，阴囊应抬高，局部热敷，热水坐浴，理疗等。可以缓解症状。如果症状更明显，局部疼痛更严重，反复发作，影响生活和工作，静脉滴注大剂量抗生素。慢性炎症性附睾炎，指伴有异常肿胀、硬结及其他炎症表现的疼痛或不适。第二类，阻塞性慢性附睾炎，指伴有先天性、获得性或医源性的附睾或输精管梗阻所致的疼痛或不适（如先天性梗阻或输精管结扎术后瘢痕形成）。