骨粉填充的危害有可能会导致牙齿出现排斥反应，还可能会造成局部破溃的现象。如果在做部分填充的时候，出现了排斥的反应，还可能会导致注射之后出现分布不均匀的现象，有时也会导致局部出现硬块等症状。在做骨粉填充的时候，最好可以选择经验比较丰富的医师操作，能够使效果更好一些。
牙根填充的骨粉对人体主要危害有因骨粉的性状不稳定，而且有不良反应（排斥反应）。还有就是注射部位会出现不匀均、有硬块、结节。注射部位变红、破溃、发炎等。由于材料是液体，它会渗入组织间隙很不稳定如想要取出，十分困难而且损伤性也很大。
牙骨粉填充有可能会引起局部牙齿的骨粉分布不均匀，也可能会诱发局部有硬块的危害。牙齿填充牙骨粉有利于缓解牙齿较薄和有利于增高牙槽，严重过程中操作不当很可能会使牙骨粉分布出现不均匀的情况发生，严重时还可能会使牙齿的局部出现有硬块和高度不一致等多种的危害。牙骨粉填充时需要选择正规的口腔科和专业医师，减少不良反应和危害性。
牙骨粉填充的危害一般是影响咀嚼，也可能会导致牙神经受损。在拔牙的时候，如果牙根较大，通常可以采取犽骨粉填充的方式进行改善，可以导致局部出血，从而对牙神经进行破坏之后可以使牙齿快速脱落。但如果在填充的时候不均匀，就有可能会引起一些不良反应，比如引起高度不平齐或者是影响咀嚼的情况。
拔牙后填充骨粉后要注意避免吃刺激性的食物，要注意口腔卫生。拔牙填充骨无缝后通常会对局部造成损伤，可能会出现轻微疼痛或者肿胀的现象，短时间内可以通过冷敷的方法进行改善，若是超过三天也可以通过热敷的方法进行缓解，在此期间要避免吃辛辣刺激性的食物，比如松江蒜或者辣椒等，而且要注意口腔卫生。
注射冻干粉填充的危害是引起皮肤过敏出现炎症，还会导致皮肤有明显的瘙痒症状。在注射前要积极和医生沟通，根据肤质这样能有效预防过敏症状发生，导致皮肤受损症状更加严重。如果想要面部所需水分，可以注射水光针或者是胶原蛋白填充，都能使皮肤处于紧致状态，有效补充皮肤所需营养，将后遗症可能性降到最低。在注射冻干粉时要做到无菌操作，这样也能避免注射过程中，皮肤出现炎症和感染等情况。