在临床上，皮脂腺囊肿的治疗一般是进行手术切除，手术切除的时候要注意要把皮脂腺囊肿的囊壁切除干净，以免造成皮脂腺囊肿术后的复发。另外切除皮脂腺囊肿的时候，最好不要将皮脂腺囊肿弄破，以免影响切口的愈合，造成切口感染；如果患者的皮脂腺囊肿位于头面部以及身体裸露部位，要注意切口尽量地要小，注意患者切口的美观。皮脂腺囊肿属于人体的良性病变，一般预后良好。
皮脂腺囊肿可以通过手术切除治好，具体分析如下：
对于皮脂腺囊肿，最好采用外科手术切除。皮脂腺等分泌物无法从毛囊出口排出，导致毛囊口阻塞，从而导致皮脂腺囊肿。由于皮脂腺囊肿存在着包膜，如果采用挤压的方式无法去除，很可能会再次发生，因此需要手术切除。通常采用局部浸润麻醉。麻醉结束后，在无菌环境下，将囊肿取出，并将其缝合。通常10天左右就可以拆开。
一般皮脂腺囊肿不能自行消除。
皮脂腺囊肿不是因为皮脂腺的分泌管堵塞，导致其上皮中的物质不断增加而产生造成的。皮脂腺囊肿可以持续数年而不会出现明显的临床表现，但是也会出现感染、破溃、复发等情况。囊肿壁有分泌作用，可产生内含物质，若不彻底清除，则容易发生反复；当囊腔的内膜腔破溃，里面的物质流出时，很容易引起炎症。皮脂腺囊肿可以通过一些特殊的方法进行彻底的清除或者是彻底的摧毁。
一般情况下，皮脂腺囊肿长熟会破，具体情况分析如下：
患者应在无感染的情况下切除，并挤出豆腐渣样的东西，如果合并感染，可以口服消炎药。皮脂腺囊肿有的比较小，有的比较大，主要发生在头皮、颜面、胸背等部位，经常吃辣、喝酒等刺激局部的环境变化引起感染，继发感染后会出现红肿等症状。
皮脂腺囊肿主要是由于皮下的皮脂腺导管出现异常，导致皮脂腺囊肿出现一定程度的变化，从而引起皮脂腺的堆积，从而在皮肤表面形成孤立或散在分布的囊肿样变化。
通常情况下，皮脂腺囊肿不能自愈。具体情况分析如下：
皮脂腺囊肿很容易继发感染和恶变，少数患者会发生恶变，恶变的几率为1.5%，所以要积极的进行手术切除。患上皮脂腺囊肿后，通常不能自愈，建议患者积极的进行手术切除，术中注意皮脂腺开口沿阻塞处扩大，切成梭形切口，小心分离囊肿，避免再次感染。如果囊肿感染、化脓时，应切开排脓，给予抗生素治疗。