最基础的区别就是硫酸软骨素是单方药物，而氨糖软骨素是氨基葡萄糖和硫酸软骨素复合而成的复方药物。其次硫酸软骨素可以和水分子结合，滋润关节部位，主要作用是促进关节软骨再生。而氨糖软骨素中氨基葡萄糖可以保持关节软骨的代谢平衡、促进胶原蛋白的合成、修复损伤的关节软骨，氨糖软骨素主要作用就是改善关节问题。
这种药物是由氨基葡萄糖以及硫酸软骨素钙两种药物结合而成。这些药物能够促进关节软骨的再生，减少关节软骨的损伤，促进关节软骨分泌关节滑液，并且能够有效的消除引起局部疼痛的炎症致病因子，从而有效的缓解膝关节以及全身多处关节的骨性关节炎症。
乙酰谷酰胺这种物质在进入到人体血液之后所可以起到的功效作用比较强大，因此乙酰谷酰胺注射液的应用范围也比较广泛，就目前而言，乙酰谷酰胺注射液主要的适应症包括神经外科手术所引起的昏迷、脑外伤性昏迷、高位截瘫、神经性头痛、腰痛、小儿麻痹后遗症、偏瘫、肝昏迷、脑瘫、眩晕症、脑族中后遗症等。
硫酸软骨素在十到二十元左右一瓶。硫酸软骨素主要是从猪的喉骨、鼻中骨以及气管这些软骨组织中提取制得的，它是一种酸性粘多糖成分。主要用于高脂血症，能够有效的预防冠心病、心肌梗死、冠状动脉粥样硬化以及心肌缺血性疾病。
硫酸软骨素片的一般售价为16.2元/瓶，根据地区的不同价格会有些有区别），硫酸软骨素可以清除体内血液中的脂质和脂蛋白，清除心脏周围血管的胆固醇，防治动脉粥样硬化，并增加脂质和脂肪酸在细胞内的转换率。效果还是比较不错的。