牙齿矫正的坏处主要是有可能导致牙槽骨发生吸收，形成人为的牙周病，也可能会产正畸性牙龈炎或者是牙周炎，因为正畸需要移动牙齿及牙根，在移动过程中可能会使周围牙槽骨吸收。
牙齿矫正包括范围较广，通常是指通过口腔技术手段，修整牙齿排列不齐、牙齿形态不正常、牙齿色泽不正常的治疗过程。牙齿矫正有多种方法，如树脂贴面、瓷贴面、烤瓷牙、正畸等，要按照个人的牙齿实际情况、牙颌畸形种类等，再综合个人要求选择治疗方法，每种方法各有优缺点，不同人各有偏好。
矫正牙齿治疗费用通常需要花费2万元到4万元左右，选择国产品牌的托槽需要2万元左右，而进口品牌的托槽需要4万元左右。如果正畸前需要通过拔牙减小牙量，则费用需多花费3千元到7千元左右。具体价格还要结合当地的消费水平。
牙齿矫正的过程中有各种副作用，对口腔卫生不好，牙齿上面粘的托槽周围容易引起牙菌斑滞留，时间久了容易引起牙龈炎。需要好好刷牙，控制牙菌斑。金属托槽也容易会导致口腔粘膜的创伤性溃疡，应该注意必要时使用正畸蜡保护。牙齿矫正的过程中，为了使牙齿移动，在牙齿上面施加外力，如果力量过大会引起牙根的内外吸收。
牙齿矫正会出现酸痛、肿胀、出血或者是不适的现象，这种现象是因为牙髓受到了伤害而导致的，可能会导致牙齿出现损伤，明显的松动现象，感染、牙周炎、牙龈萎缩、牙根暴露等现象。卫生习惯不好，饭后不刷牙，牙齿上残留了食物残渣发酵后产生的酸，会对牙齿产生副作用，使牙齿变黄或者是有坑洼现象。