较多见的生理性卵巢囊肿是月经周期中正常的卵泡持续生长，这种囊肿通常不会引发健康问题，也很少导致身体疼痛不适，一般在2~3个月经周期会自行消失，不需要进行治疗。如果反复出现生理性卵巢囊肿，女性患者就要及时去医院做性激素六项检查，同时也要改善自己的生活方式，改善饮食习惯，避免吃辛辣刺激性食物，避免吃富含激素的食物。
生理性卵巢囊肿也就是黄素囊肿，囊肿一般不会太大，多在妊娠三月后自行消失，少数人囊肿可能较大发生破裂引起腹腔内出血，还有些人发生囊肿蒂扭转，病理性的不会消失，这两种情况都伴有突发剧烈腹痛，严重者伴有休克症状。应该注意腹痛的，有不适感及时到医院就诊，没有不适也不要为囊肿担心。
生理性卵巢囊肿的原因有卵泡、黄体囊肿等。在正常的生理周期中，在增生期会出现卵泡的成长，最终形成一个成熟卵泡；在排卵过后或者怀孕初期，可能出现黄体囊肿，这些都是生理性的，没有什么问题的，会自动消失。可以在下次月经干净后的3-7天复查彩超可以确诊。
生理性卵巢囊肿可能是环境因素、饮食、内分泌等原因导致的。如果生活环境中存在电离辐射，可能会导致人体内分泌失调，造成卵巢囊肿。如果进食过多富含植物生长激素、瘦肉精类等激素食物，可能会导致激素分泌异常，形成卵巢囊肿。如果体内激素水平不稳定，内分泌旺盛，过多的雄激素，可能会出现生理性卵巢囊肿。女性可以注意日常护理，调节作息。
一般情况下，生理性卵巢囊肿可以采用以下方式来去除：
患有生理性卵巢囊肿，没有出现明显的不适症状，可以暂时不治疗，进行临床观察。生理性囊肿一般会自己消失。患有生理性卵巢囊肿，如果囊肿很大，有腹胀、腹部疼痛等症状，可以进行穿刺。生理性卵巢囊肿如果在短期内增加的幅度很大，可以进行手术来切除。患者可以根据自身的实际情况，选择适合自己的治疗方式。
一般情况下，生理性的卵巢囊肿是由于女性在月经周期中出现了卵泡的发育过度，或是由于黄体的生长太大而导致的，具体分析如下：
正常来说，这个生理上的囊肿在一星期内就会自行消退。女性来月经后要做常规检查，一般不需要做特别的治疗。而病理性囊肿在经期过后会一直存在，不会自行消退。女性经期过后做B超检查，可以明确诊断为生理性卵巢囊肿。