脑血栓的治疗主要分为内科治疗、外科治疗和后期的康复治疗三种。内科治疗主要是在脑血栓的急性期，可以使用溶栓或者降纤的治疗，并且进行脑保护治疗，防止因为脑血栓而导致的并发症的出现。如果脑血栓的面积比较大，出现了脑水肿甚至脑疝的形成，可以通过手术减压。
针灸治疗脑血栓的效果还是不错的，可以疏通经络，调节气血，促进脑血栓的健康，还可以降低血液粘度，抑制血小板聚集和粘附，抑制红细胞聚集及降低血球压积，达到增加脑血流量，改善脑细胞供氧，促进脑细胞恢复功能。
对于脑血栓后遗症恢复作用不错，豨莶通栓丸用于：活血，祛风，化痰，舒筋活络，醒脑开窍。缺血性中风脑血栓的急性期和恢复期引起的肢体麻木、半身不遂、口眼喎斜、左瘫右痪、语言障碍等。
可以到当地的正规的三甲医院通过自身的症状和脑部的后遗症等选择正规的治疗方法。治脑血栓做好以改善脑部的血液循环为主，可以通过活血化瘀，清肝通络的药物。平时要注意病人的情况，不要太过激动。
艾灸治疗脑血栓，取穴百会、大椎、风池、肩井、足三里、曲池、太溪，可以直接用灸也可以用温和灸，在这里主要是温和灸，用艾条点燃后对准实灸的穴位做温和灸，始病人感觉到热感，每穴十至十五分钟，十天为一个疗程，一个疗程后会改善，休息三至五天可以继续下一个疗程。
治脑血栓的药物必须注意检查脑血栓种类。
通常脑血栓可由某些动脉粥样硬化引起部分血栓，这一状况需要遵医嘱施用某些抗血小板和降脂药物辅助治疗，降低后血栓，并应施以某些修复神经药物辅助治疗，改善部分脑血栓形成症状。治疗期间注意休息，避免过度劳累和情绪激动，保证充足的睡眠，注意饮食健康，避免吃辛辣油腻的食物。