一般情况下，艾灸肛门对直肠炎的治疗，能达到辅助治疗的效果。
直肠炎多由肠道内菌群失调、有害菌滋生引起，而艾炙通常无杀菌、消炎之功效，故艾灸无法直接用于直肠炎，只能起到辅助治疗的作用。直肠炎以药物治疗为主，在平时要注意生活作息规律，尽量不吃辛辣刺激性食物，不要滥用抗生素，以免对肠道正常菌群造成损害，这样才能控制直肠炎病情。
直肠炎的治疗原则有以下几点：中药治疗，应以健脾补肾，益气除湿为治本之法，清热解毒，活血化瘀为治标之用，辨证施治。西药治疗，根据病人炎症明显时可短期使用抗生素配合其他的药物调节肠道功能，需要在医生的指导下进行心理治疗。心理治疗，该病多伴有焦虑，抑郁，紧张，多疑等精神心理改变。
直肠炎病人可以吃紫苋菜粥，取适量的紫苋菜，白米，加工的方法是先把苋菜洗净之后切小点，然后就可以在锅里加适量的水，然后用水煮苋菜，煮好之后取汁去滓，用汁煮米成粥，病人可以在平时晨起做早餐服之，有利于直肠炎的恢复。
直肠炎的治疗有灌肠，对于粪便硬块嵌顿导致的直肠炎应采取灌肠，解除粪便压迫。由于引发直肠炎的病因较复杂，治疗原则应根据引发直肠炎的病因及疾病采取相应的治疗措施。可以通过粪便、涂片或活检组织进行细菌、真菌和病毒检测；相关抗体及毒素测定。要注意休息和饮食。
最三个月是可以得到恢复的，但是也是不一定的，如果病情比较严重，在治疗的过程当中有没有积极的配合医生，那么需要花半年的时间才能治好。平时多注意饮食调理，少吃辛辣，刺激性食物，多注意腹部保暖，防止着凉，生活饮食规律。
直肠炎的治疗过程一般都是比较漫长的，而且多久能恢复也得看病情和治疗的方法，直肠炎平时的时候要好好的疗养，多数三个月可以恢复，但是如果病情严重，就得需要更多的时间了，有些甚至患有直肠炎几十年。