导致精子畸形率高的原因很多，酗酒、吸烟会导致精子畸形，泌尿生殖系统感染，是造成精子畸形的一个主要的原因，内分泌紊乱，化学制剂、环境污染以及辐射等因素，都很可能会造成精子畸形的发生。
精子畸形常表现为倦怠乏力，纳食不香，腹胀闷，或腰膝酸软，伴有精索静脉曲张可有睾丸坠胀表现。有的出现男性不育的相关病症表现。还有一些畸形精子的男性病人有性功能障碍。
致畸形精子多的原因主要是抽烟、喝酒、环境污染或疾病等导致的。建议首先要避免接触有毒有害物质，禁烟酒，避免污染环境影响。同时可以配合用中药调理。也可以进一步针对做下精子形态学和生精细胞学等检查查明具体导致精子质量下降原因。针对性的治疗效果显著，生活上注意卫生饮食清淡有营养，适当身体锻炼，避免久坐或长时间处于高温状态下工作环境要注意更换。
引起的原因有：不健康的生活方式，酗酒也是常见的造成精子畸形的原因之一：已有研究证实，酗酒产生的酒精中毒可能损伤精子，造成精子畸形率增高，同时还可造成性欲冷漠、阳痿、早泄等性功能的异常。再者男子泌尿与生殖系统的某些感染：也是造成精子畸形的重要原因之一。较常见的影响精子畸形的感染，如：前列腺炎、精囊炎、尿道炎等。
引起精子畸形的常见原因有内分泌功能下降;生殖系统与泌尿的某些感染;酗酒引起的精子畸形;吸烟会使畸形精子发生率明显增高。生活中可以把这些因素尽量避免！年轻男性如果是长期久坐如司机的职业也会出现精液影响。
生理危害：造成不育。精子的凝固是由精囊产生凝固蛋白所致，而液化是由前列腺分泌的一系列蛋白水解酶即液化因子作用的结果，所以前列腺和精囊发生炎症，使其分泌功能紊乱，使精子凝固因素增加或液化因素减少，造成精子不液化。精子不液化使精子被粘液网罗，阻碍其在女性生殖道中的运动能力，造成男性不育。精子不液化使精子活动受限，减缓或抑制精子进入子宫腔受精而引起不孕症；精子粘稠度增高，将影响精子活力和存活率。