肛周脓肿术后的治疗方法有1、排便后及时用温水清洗患处，遵医嘱定期伤口换药，避免桥型愈合。2、抗炎、支持、对症治疗。3、加强营养，蔬菜、水果、肉蛋奶都可以食用，有利于创口的愈合4不能因为害怕大便疼痛就不吃饭，必要时可以遵医嘱使用止痛药物治疗。
可在切开脓肿后，用探针仔细检查内口，然后切开瘘管，适当切除皮肤和皮下组织，内口周围组织也稍加切除，使引流通畅。如内口较深，瘘管通过肛管括约肌，可采用挂线疗法。以上手术优点是脓肿一期治好，不再形成肛瘘。但在急性炎症中，找内口有困难时，不应盲目寻找，以免炎症蔓延或形成假道，仅做切开排脓，待形成肛瘘后，再做肛瘘手术。二期手术优点是效果准确，治好的可能性高。
发现肛周脓肿，一定要进行积极的治疗，早期的肛周脓肿，也可以采用输液的方式，使他的肿块逐步的缩小。肛周脓肿，要达到治疗好的目的，都是需要手术进行治疗的。先进行一次切开排脓的手术，再等三个月之后，一旦形成肛瘘了再进行一次二期手术。
初期肛周脓肿治疗去做肛门指诊检查，肛镜检查等。查找病因对症治疗。生活中注意调养，按时作息，少熬夜，多喝水，多吃新鲜的水果和蔬菜，忌食辛辣等刺激性食物，保持大便通畅。
任由肛瘘发展，会对括约肌造成严重损伤，甚至可能造成肛门失禁等并发症。肛瘘的多发会形成直肠阴道瘘、直肠尿道瘘和直肠膀胱瘘，危及周围脏器，并且多年未治或误治的老肛瘘有癌变的可能。肛瘘的多次反复发作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而成多发性、复杂性肛瘘，不但给治疗带来困难，而且也影响到肛门的生理功能。
主要是疼痛，最初的疼痛，化脓时跳痛，排便时疼痛加重，脓肿，在肛门前方可发生尿潴留，脓肿肛门后方出现在尾部疼痛，全身中毒症状轻，局部肿胀，红肿，压痛，有波运动。局部见肛门一侧，发红，肿胀，压痛，燃烧，痛苦的疼痛，活动和排便时疼痛加重，有排尿困难。