不可配伍的药物：二性霉素B、青霉素类、头孢菌素类、氯霉素、红霉素、肝素钠、钙制剂、磺胺嘧啶钠和含维生素C的复合维生素B。避免与以下药物联用或相继使用：卡那霉素、新霉素、多黏菌素、巴龙霉素、链霉素、速尿、利尿酸。
本品不宜和抗凝血的药，比如双香豆素，肝素，以及溶栓药同用。抗酸药，比如碳酸氢钠等可以增加本品自尿中的排泄，使血药浓度下降，也是最好不要一起使用。本品和糖皮质激素，如地塞米松等，一起服用，会增加胃肠道不良反应。
硫酸新霉素为氨基糖苷类的抗生素，口服避孕药物长期合用可导致避孕失败，并增加出血的概率。可影响洋地黄、氟尿嘧啶、甲氨蝶呤、维生素a、维生素b12的吸收，使疗效降低。硫酸新霉素不宜与其他肾毒性的药物及耳毒性药物合用。与神经肌肉阻滞药合用时，可增加神经肌肉阻滞的作用，导致骨骼肌软弱等。
阿莫西林与氨基糖苷类药(如庆大霉素、卡那霉素)、环丙沙星、培氟沙星等药属配伍禁忌。阿莫西林是一种最常用的半合成青霉素类，属于广谱的β-内酰胺类抗生素，为一种白色粉末，所以输液的时候，有一定的配伍禁忌。
在发烧的时候，其实不太主张专门用清开灵来进行治疗，但是清开灵可以起到一些辅助的治疗效果。其实针对发烧的治疗，需要针对病因以及对症治疗，在对症治疗方面，可以先给物理降温，如果物理降温治疗效果不理想，就可以联合一些退热的药物，比如非甾体内类药物，包括芬必得、对乙酰氨基酚等。
咳嗽一般不需要吃清开灵。虽然清开灵可以起到清热解毒的功效，同时还可以起到镇静安神的作用，如果只是单纯的咳嗽，并没有出现喉咙肿痛情况，通常不需要吃清开灵。可以听从医生的指导服用川贝枇杷膏进行治疗，若咳嗽比较频繁，还可以采取雾化止咳，治疗效果比较理想。在服用药物之前，还应让专科医生定好药物剂量，不要盲目的服用药物。