本病属于病毒感染性疾病，也属于自限性疾病，会出现体温升高，且发烧的持续时间为三至五天，整个病程会持续一周到两周。本病在感染病毒时，还存在一定的潜伏期，潜伏期为1到5天，时间长短因人而异。
疱疹性咽炎主要是有疱疹病毒感染而引起的，有效的治疗方法为抗病毒治疗，如果发烧不超过39度，可以使用物理降温，用毛巾包裹冰袋放于腋下或腹股沟处，如果发烧超过39度，可以使用药物治疗。
通常情况下，宝宝得了疱疹性咽炎可以吃清热解毒的药物，比如口炎清颗粒、蒲地蓝口服液等。而对于合并有周围口腔、咽喉部黏膜急性感染的宝宝，一般可酌情联合使用抗生素抗感染，常用青霉素类、抗菌素、头孢菌素类的抗菌素。但如果宝宝呈现反复出现的高热症状，还可以使用一些退热的药物，比如布洛芬混悬剂。
宝宝如果长时间吞咽困难，出现脱水、体力不佳的情况，还可酌情考虑，输液行补液及支持治疗。
疱疹性咽炎是一种由柯萨奇病毒等病原体所致的咽峡部炎症，多见于3-10岁的儿童，也可见于成人。本病常发于夏季和秋季，有传染性，可经粪便、口腔、呼吸道、接触等途径传播，临床表现为高热、咽痛等。
检查咽部、软腭、悬雍垂等处的皮肤呈灰白色，直径1-2mm，周围有红晕等疱疹。通常症状会持续4~6天，并伴有咽部充血。柯萨奇病毒也会导致中枢神经系统病变、心脏病变、流行性肌痛、手足口病等疾病。
小儿疱疹性咽炎是由科萨奇病毒引起的，夏季和秋季发病率最高。以口服清热解毒的中药配合抗病毒药物为主。大多数的孩子7天左右就会好。治疗期间要让孩子多喝水，不吃带有刺激性的食物。
疱疹性咽峡炎是因为宝宝感染了肠道病毒而引发的症状，与儿童手足口病是同种类病毒，一般伴有发热症状。有的孩子可能几天就会痊愈，但有的孩子可能会接着出现手足口病。虽然是病毒感染的自限性疾病，但是因为发病孩子多年龄幼小、抵抗力低，所以有些重症患儿的病情往往进展迅速，不容小觑。建议家长带孩子到儿科就诊，查血常规、肠道病毒检测等检查，再对症抗病毒治疗。平时要注意勤洗手，多漱口。