导致卵巢囊肿的原因有很多，一般与遗传因素、内分泌水平、心理压力、乱用激素类药物、滋补品等有一定的关系。饮食结构不合理、生活习惯不好、进食的食物受到污染都有一定的关系。患有卵巢囊肿要引起注意，此时容易出现感染、卵巢肿瘤、卵巢囊肿蒂扭转等疾病。如果是单纯的卵巢囊肿比较小，对身体一般没有影响，但是需要定期复查。
通常卵巢囊肿蒂扭转考虑是卵巢囊肿增大，在重力作用下发生扭转，可能是卵巢囊性病变、妊娠期囊肿改变等引起的。
1、卵巢囊性病变：女性患有卵巢上皮性囊肿、畸胎瘤等疾病，肿瘤生长增大，重量增加，在重力的因素下可能会引起卵巢发生蒂扭转。
2、子宫大小变化：如果女性处于妊娠期、产褥期，雌激素可能会刺激导致卵巢囊肿迅速增大，而卵巢受子宫大小变化受到牵拉。
家里有遗传因素，或者内分泌因素，还有分泌的腺激素的重要器官，还有在生活方面的因素，过于长期生活饮食结构，生活习惯非常不好，心理压力过大，还有一些环境因素影响的。
卵巢囊肿有生理性的囊肿和病理性的囊肿，生理性的囊肿一般没有症状，病理性的囊肿可能引起腹痛，增大，破裂等，原因主要有：下丘脑-垂体-卵巢轴功能异常，临床上很多病人和多囊卵巢综合征病人的基本病理生理改变是卵巢产生过多雄激素而雄激素的过量产生，是由于体内多种内分泌系统功能异常协同作用的结果。
卵巢囊肿一般分肿瘤像非主流像，而生理性囊肿，一般就是所说的非肿瘤性囊肿，非肿瘤性囊肿一般会自行消失的。而肿瘤性囊肿，是否恶化都需要及时手术切除的。生理性囊肿一般于产后受寒，气血出现凝滞的现象都会引起的。如果囊肿不是很大，可以进行观察的。
卵巢囊肿发病原因有，生理性原因：多发生于排卵期的育龄期女性，生理性卵巢囊肿常可自行消失，不需特殊处理。病理性原因：包括畸胎瘤、子宫内膜异位囊肿、交界性卵巢囊肿等。病理性卵巢囊肿不会自行消失，需要定期复查B超。若囊肿体积＞5cm，应及时进行手术切除。