百日咳在恢复期，出现发低烧的情况，首先应选择合适的方式来进行降温处理。例如通过温水擦浴、使用物理降温贴、冰袋等方式来进行降温。并在此期间，保证患儿多饮水，卧床休息，补充能量、维生素及膳食纤维等食物，以促进健康的恢复。同时，也要到院就诊进行进一步的体格检查，以明确原因，查看是否存在继发感染或是疾病相关并发症的出现而导致，再根据病因进行正确规范的治疗，从而促使疾病的康复。
通常对症治疗。按呼吸道隔离。保持空气清新，注意营养及良好护理。避免刺激、哭泣而诱发痉咳。在药物上可以选择敏感抗生素治疗。控制感染可以服用一些消炎药来控制，另外不能吃辛辣刺激性食物和生冷食物。需要多喝白开水。如果情况依然没有减轻需要及时去医院进行下一步治疗。
百日咳出血应该要增强儿童抵抗力、免疫力。儿童接触百日咳杆菌，则会导致咳嗽、祛痰、痉挛性咳嗽，并可能出现发热现象，这可以通过肺部ct，也可以通过细菌培养试验确诊，如果试验证实，一般可以选择使用抗生素这类药物至少半个月，并使用药物帮助止咳化痰。
百日咳需要及时住院治疗，按呼吸道传染病隔离。为保持呼吸道通畅和利于分泌物的排出，痰多时要吸痰，患儿痉咳时注意低头体位，拍背。为防止婴儿突然窒息，夜间易发生，应有专人守护，一旦窒息及时处理，人工呼吸，吸痰，给氧。有呼吸暂停或抽搐，进行气管插管和呼吸道持续正压给氧治疗。口服药物可解除痉挛症状。
需要按呼吸道隔离，保持空气新鲜，避免可诱发痉咳的因素。加强护理以预防并发症，注意营养。幼婴儿窒息时应即刻行人工呼吸，给氧，必要时给予止痉排痰。平时注意多喝水，饮食要少吃多餐，不吃辛辣等带有刺激性的食物，做到室内的空气流通，保持室内空气清新，还要避免烟尘等因素刺激而诱发咳嗽。
婴儿患上了百日咳需要按呼吸道隔离，保持空气新鲜，避免一切可诱发痉咳的因素。加强护理以预防并发症，注意营养。幼婴儿窒息时应即刻行人工呼吸，给氧，必要时给予止痉排痰。