婴儿咖啡斑是不会自行消失的。
许多婴儿在出生后可能会出现咖啡斑，并且不同的患者也会有不同的症状。有的咖啡斑的颜色更深，边缘更清晰，面积也更均匀，使用激光进行治疗效果更好，通过多次激光治疗后，大部分患者都能得到根治，甚至有的时候使用激光也无法达到预期的效果。婴儿出现咖啡斑要到医院检查，建议到皮肤科进行检查，具体的治疗方法和时间要结合婴儿的具体情况。有的婴儿年纪太小，可以等他们长大了，再来治疗。
婴儿咖啡斑可能在出生时就有，也可能在幼年时发病，主要症状是皮疹。
皮疹呈淡褐色或深褐色，像咖啡和牛奶混合的颜色，所以也叫牛奶咖啡色，咖啡斑也叫牛奶咖啡斑。形状不一，呈现圆形、椭圆形或是不规则形，直径大小不一，大概1.5cm-15cm。随年龄增长皮疹数量可能增多，面积变大，不能够自行消退。在躯干、四肢或其他的部位发生。
咖啡斑是一种先天性色素沉着性皮肤病，常见于新生儿，具体分析如下：
咖啡斑是在出生时或出生后不久发现的褐色斑块，多发于面部和躯干，呈散在分布。咖啡斑的斑块大小不一，形状不同，界限清楚，可随年龄增长而增大、增多。咖啡斑还可能会随着年龄的增长有所消退，一般无需进行特殊处理。若咖啡斑影响到了外在美观，可以进行冷冻治疗。该方法是通过冷冻液态氮作用于咖啡斑表面，令局部组织在瞬间被冷冻，使表皮色素细胞坏死，以达到去斑的目的，效果可维持2~3年，具体时间因人而异。
咖啡斑越长越多考虑是年龄增长、神经纤维瘤病等原因引起的。
1.年龄增长：咖啡斑并不是一种终身不变的疾病，会随着年龄的增长而变多或者变大，这一般是正常的，如果未伴有其他不适症状，基本不用采取手段进行治疗。日常生活中，建议要注意防晒，多吃富含维生素的蔬菜和水果，注意皮肤的清洁和干燥，有利于改善咖啡斑。
2.神经纤维瘤病：神经纤维瘤病是一种常染色体显性遗传性疾病，表现为咖啡斑、雀斑和色素沉着等症状，随着病情的进展，可能会出现咖啡斑越长越多的情况，还可能出现耳聋耳鸣、眩晕等症状。建议及时就医检查，明确具体的病情后，积极配合医生采取手术切除的方式进行治疗。
治疗期间，建议保持轻松、愉快的心态，多注意休息，多吃富含维生素和蛋白质的食物，有利于身体恢复。
一般来说，“哪里治疗咖啡斑最好”的说法并不严谨，通常患者前往正规的医疗机构治疗咖啡斑比较好。具体分析如下：
咖啡斑是数毫米至数十厘米大小不同的浅褐色、棕褐色至暗褐色斑块，皮损通常呈圆形、卵圆形或形状不规则，边界清楚，表面光滑。通常患者前往正规的医疗机构治疗咖啡斑比较好，患者可以选择冷冻治疗的方式进行处理，该方式主要是借助液氮将病损皮肤冻伤，进而使其脱落，从而去掉皮下的咖啡斑。
此外，患者术后应该注意护理，以免出现感染的情况，进而不利于皮损恢复。
咖啡斑多数需要治疗，具体根据自身实际情况诊断。
咖啡斑颜色比较浅或者面积较小，多数不会导致美观受到影响，不需要特殊治疗，但要做好防晒，不能受到强烈紫外线照射，以免导致颜色加深或者面积增大。如果咖啡斑比较严重或者咖啡斑面积比较大，会对面部美观造成很大影响，还会打击到个人自信心，因此需要治疗。
去除咖啡斑可选择激光祛斑，利用性光热原理瞬间爆发巨大的能量，作用于色素组织，能够将色素击碎或者分解，被巨噬细胞吞噬掉，从而可以随着自身淋巴系统排气排出体外，达到祛斑作用。