治疗习惯性腹泻有使用药物、调节饮食、针灸等来治疗。
如果出现了严重的腹泻，患者可以通过粪便常规和胃镜等辅助检查来确定是否存在明显的病原菌感染。如果是实质性的炎症，可以口服蒙脱石混悬液、复方黄连素、颠茄片等药物。日常生活中要多喝一些姜糖水，不要吃油炸、腌制、熏烤的食品，不要喝浓茶、咖啡等刺激性的饮品。另外也可以选择针灸治疗，比如针灸足三里、中脘等。
有可能是饮食不洁导致的腹泻，而且伴有腹痛，所以可能有肠道的痉挛，如果要治疗，需要到医院检查一下大便常规，确定是否有感染的情况。适当用一些抗炎药物，要多补充水以防脱水。
不是很严重的幼儿腹泻可以服用止泻药物缓解腹泻症状，口服适当的电解质溶液或者淡盐水预防脱水电解质紊乱。观察孩子腹泻的量，避免引起严重的脱水。如果伴有发热，腹泻量较大。应及时到正规医院进行检查，输液治疗，预防严重脱水电解质紊乱。
对于小儿腹泻，首先需要注意在腹泻急性期，需要注意孩子的饮食，尽量引流至饮食为主，选择一些清淡容易消化的食物，避免增加胃肠道的负担，让胃肠道得以休息其次，治疗上主要是药物为主，通过给宝宝吃一些止泻的药物来缓解腹泻的症状。
注意个人合理饮食清淡，避免辛辣刺激食物，易消化吸收为主食物。及时检查抗病毒对症处理，到正规医院就诊，进行血常规、c反应蛋白、大便常规等检查，根据检查结果，针对致病菌选用相应的药物治疗。