气管镜检查是呼吸科的常用检查手段，已经广泛应用于临床，该检查的主要后遗症主要包括喉痉挛、低氧血症、出血、气胸等。有些患者会出现发热。主要是术后出现的发热，多继发细菌感染、菌血症，败血症偶有发生。部分患者会出现眼睛充血的的症状。但可以很快消失，多数在1至2天内可以完全恢复正常，一般无需进行治疗。需要注意的是，使用支气管镜进行治疗时，可能会对支气管造成影响。
纤维支气管镜检查的禁忌症主要包括大咯血、严重心肺功能失常、合并急性心肌梗塞以及严重呼吸困难。纤支镜检查的禁忌症是相对的，临床上并没有绝对禁忌症，包括大咯血和严重心肺功能衰竭，通过气管插管抢救之后，如果有需要，仍然可以在床旁进行纤支镜检查。这种检查是将细长光导纤维支气管镜经口或经鼻伸入下呼吸道,经过声门进入气管和支气管及更远端,直接观察气管和支气管病变,根据病变进行相应检查和治疗。
比较以前的支气管镜检查它的痛苦较前是明显减轻的，以前是硬质气管镜，它是一个长长的铁管子从嘴中直接到喉气管里面，现在称之为纤维支气管镜，它的柔韧性比较好；它的粗细度比较细。
右肺中叶看见了一些细索条影，不像是肺癌的特征性的影像学改变，有一些像是肺部炎症引起的情况。也可能是以前感染肺部遗留下来的陈旧病灶。可以做一个详细的检查，确诊一下才能对症治疗。
支气管镜检查后会咯血，若量较少，多数属于正常现象。主要由于在进行支气管镜检查过程中，会引起鼻腔、支气管黏膜损伤，出现少量咯血。再者，在此项检查过程中，若有异物存在，活检时也会出现支气管咯血。需要注意的是，若咯血量在可控范围内，不用特殊处理；但是若咯血量较大时，则要引起高度重视，要及时查找原因进行处理，避免出现窒息，危及患者生命。
气管镜检查的时间大概需要十分钟到二十分钟左右，部分医院可能需要半个小时左右。这是检测呼吸道感染疾病较为常用的一种方法，可以有效掌握气管部位是否出现炎症感染，或者是结核、肿瘤等异常病变，然后进行有针对性的治疗。另外在治疗期间还要定期去医院进行复查工作，要根据病情的发展变化及时更换治疗方案和用药，这样也能促进病情更快恢复。