肛周脓肿的治疗方法，包括非手术治疗和手术治疗。非手术治疗方法包括应用抗生素治疗，也可以采取温水坐浴和局部理疗，以减轻排便时的疼痛。脓肿切开引流是治疗肛周脓肿的主要方法，一旦诊断明确，即应切开引流。肛门周围脓肿切开引流术，在局麻下就可以进行，在波动明显处做与肛门呈放射状切口，不需填塞，以保证引流。
肾脓肿治疗主要是脓液引流及抗炎输液控制感染治疗。如果合并糖尿病应该积极控制血糖，否则患者有感染性休克甚至死亡的可能。脓液引流可根据脓肿的大小，采取经皮肾穿刺引流和手术切开引流。也可以根据细菌培养结果使用敏感的抗菌素。
轻度肛周脓肿可以用药物涂擦皮肤，每天3到4次，口服药物消炎化脓，不要吃上火的食物，多吃新鲜的水果，保持大便通畅，后囊肿继续增大，也可以外科手术切除囊肿，手术后预防性的应用消炎。
轻度肛周脓肿可以用药物涂擦皮肤，每天3到4次，口服药物消炎化脓，不要吃上火的食物，多吃新鲜的水果，保持大便通畅，后囊肿继续增大，也可以外科手术切除囊肿，手术后预防性的应用消炎。
治疗盆腔脓肿可以通过药物治疗的方法，但是药物治疗能够取得疗效，还会有遗留的现象发生，病人也可以采用手术治疗的方法，可以使病情得到缓解，手术比较安全，可以尽快的达到治好的效果。
肛周脓肿的病情，那看现在症状不是很严重，那也可先不用手术也行的这时可外用上抗炎的药膏结合上口服的抗炎药物治疗上一段时间看看效果也行，如果说药物保守治疗效果不好，脓肿有增大并且出现疼痛的症状较严重时，这时在考虑手术治疗也行的。