精索静脉曲张术后的并发症有四种：炎症、出血、睾丸萎缩、输精管阻塞。如果是早期的并发症，比如睾丸萎缩和输精管堵塞，都是比较严重的并发症。手术中一旦发现有炎症，应立即应用抗生素，但如果在结扎过程中，结扎的绳子会掉落，导致手术区内出血，必须重新进行止血。术后出现严重的并发症，可能是因为手术时对精索血管和输精管造成的。
精索静脉结扎术后水肿是常见的并发症，发生率为3%～33%，平均为7%，淋巴管损伤或被结扎是引起水肿的原因。术后睾丸萎缩或精子缺乏，多数是由于手术时结扎或损伤睾丸动脉引起。动物实验和对人的研究表明，睾丸动脉结扎会很大程度地引起睾丸损害，尤其是不育症得病人。
不会消失，精索静脉曲张的手术只是在血管曲张的地方进行一个血管结扎的手术，所以不会把全部的静脉曲张血管都剔除掉，所以在手术以后不会出现完全消失的，也会保留一部分，一般手术后的修复也是很关键的。手术以后需要多卧床休息。
精管损伤输精管损伤是精索静脉曲张手术的一种严重并发症，因术中需要将精索静脉结扎，所以很容易误扎输精管及其动脉。输精管是一种呈白色，且触之质地坚韧的管状结构组织，与周围血管等颜色和结构略有区别，需引起高度重视。局部疼痛部分精索静脉曲张行结扎术后会出现腰背部、睾丸等处的疼痛症状。
患肢肿胀是下肢静脉血栓形成后最常见的症状。患肢张力高，无抑郁性水肿。皮肤呈红色，皮肤温度高于健康侧。当肿胀严重时，皮肤上可能会出现水泡。肿胀的位置随血栓的位置而变化。髂股静脉血栓形成患者患肢肿胀明显，下肢静脉丛血栓形成患者仅限于下肢，下腔静脉血栓形成患者下肢肿胀。
下肢深静脉血栓形成又称下肢深静脉血栓，是常见病，是指由各种原因所致下肢静脉血流缓慢，血液呈高凝状态，淤积在下肢静脉，形成血栓。此病可遗留下肢水肿、继发性静脉曲张、皮炎、色素沉着、淤滞性溃疡等。