多囊卵巢和卵巢囊肿相比，多囊卵巢更为严重。是因为多囊卵巢属于内分泌疾病，常常是由于遗传因素和环境因素相互作用导致的，由于卵泡不能正常生长发育和排出，因此就会导致女性出现月经失调、面部痤疮，甚至肥胖等其他并发症，还可能影响女性的生育功能。卵巢囊肿可能是生理性囊肿，也可能是普通的卵巢囊肿，或者是子宫内膜异位症导致的卵巢巧克力囊肿这些疾病通过手术治疗以后往往都可以治愈，而且不容易影响女性正常受孕。
下腹部疼痛是附件炎常见的症状，右边的是右侧附件炎，最容易被误诊为阑尾炎和卵巢囊肿。是一种转移性的下腹部疼痛，转移性的下腹部疼痛是一种典型的症状，如果症状持续下去，会有右下腹的疼痛。而右边的一个囊肿蒂扭曲，则说明曾经有过卵巢囊肿，无论是在做什么，都很容易被诊断为阑尾炎或者是卵巢囊肿，在b超的帮助下，患者会有发热，或者是有强迫的姿势，在做完妇科检查后，可以感觉到，如果是有附件炎，应该和这两种情况进行区分。
卵巢癌属于卵巢恶性肿瘤，在早期常无症状。而卵巢癌一旦有不适症状，往往就属于晚期，比如会出现便秘，腹胀，或者自己摸到腹部包块。卵巢囊肿包括卵巢生理性囊肿，卵巢良性病理性囊肿以及卵巢恶性肿瘤。
盆腔炎和附件炎会导致囊肿。如果是良性卵巢肿瘤，就要切除患侧卵巢肿瘤，同时做病理检查，但术后易复发。恶性肿瘤者手术是首选方法，其手术范围要广，一般都切除全子宫，术后还须进行化疗、放疗。
一般情况下，子宫囊肿和卵巢囊肿是完全不一样。
先囊肿生长的位置不同，子宫囊肿是指宫颈上的纳氏囊肿，所以囊肿是在宫颈上形成，子宫囊肿长在子宫肌层，大部分由于子宫腺肌病引起子宫的小囊肿，这些囊肿里大部分有巧克力样的积血，由于异位子宫内膜随着月经周期出现出血引起，这种囊肿不需要特殊治疗，如果子宫腺肌病比较严重需要做子宫切除。
通常来说，宫颈纳氏囊肿和右侧卵巢囊肿可以通过手术进行治疗。
宫颈纳氏囊肿同宫颈柱状上皮异位、宫颈息肉一样，是慢性宫颈炎常见的一种表现，可以通过腹腔镜下卵巢囊肿摘除术；右侧卵巢囊肿是卵巢内或其表面形成的囊状结构，一般不会对人体造成损害，大多数患者的可自行消失，但部分患者的囊肿可不断增大，引起下腹部不适、月经异常等，可以通过手术进行治疗，比如卵巢囊肿剔除术、单孔腹腔镜下卵巢囊肿剥除术、卵巢切除术等。