主要疗法有脑异电全息治疗、物理治疗、迷走神经刺激术、心理认知功能训练、生酮饮食治疗、西药治疗、中药治疗和手术治疗等。多吃富有营养、易于消化的食物，如面食、豆类、瘦肉、鸡蛋、鱼、牛奶等，尤其应多食用豆类、新鲜蔬菜、水果、乳制品。
一般情况下，酒精中毒精神障碍在临床上较为常见，可以给小剂量抗精神病药物氯丙嗪和氟哌啶醇，对于伴焦虑，紧张和失眠症状者可以给苯二氮卓类药物氯硝西泮，劳拉西泮和阿普唑仑，对于情绪抑郁患者可以给抗抑郁药物五羟色胺再摄取抑制剂氟西汀、帕罗西汀、舍曲林和西酞普兰。对于抗精神病药物利培酮和喹硫平不应该过多使用，如果药物用量过少使用，则可以给抗精神病药物利培酮和喹硫平联合用药。
可以口服调节神经的药物来治疗，器质性精神障碍，首先要积极治疗导致精神症状的器质性病因，在进行相应的病因疗法后，症状就可得到缓解。也要对症治疗症状。因为精神症状的存在，会影响躯体疾病的治疗。
器质性精神障碍是指由脑部疾病造成的精神障碍，是一种精神类疾病，制定合理的治疗方案，避免拖延治疗时间，通常这种病情会使人出现幻觉症状，平时保持良好的生活习惯，保证日常营养均衡。
甲状腺功能异常伴精神障碍表现，起病时间相对较慢，少数起病于较重外伤时、精神刺激及感染时起病剧烈，使人体多汗、心律不齐、胸闷气短、月经减少等，甚至闭经，血压增高等表现，患了这种病的患者，要进行心理抚慰，主要是心理治疗，需要有耐心地做疏导和鼓励工作，对该病进行健康教育，使病者主动配合诊治。
此外，可以通过听音乐、散步等方式辅助治疗。
对兴奋躁动并确诊为非颅内出血所致者，在密切观察瞳孔与意识状态情况下，予以小剂量抗精神病药或抗焦虑药。脑外伤后综合征与神经症采用相应神经症的治疗，恐惧与抑郁可选用三环类抗抑郁药治疗，脑外伤后精神病可选用抗精神病药治疗。