在临床上，皮脂腺囊肿的治疗一般是进行手术切除，手术切除的时候要注意要把皮脂腺囊肿的囊壁切除干净，以免造成皮脂腺囊肿术后的复发。另外切除皮脂腺囊肿的时候，最好不要将皮脂腺囊肿弄破，以免影响切口的愈合，造成切口感染；如果患者的皮脂腺囊肿位于头面部以及身体裸露部位，要注意切口尽量地要小，注意患者切口的美观。皮脂腺囊肿属于人体的良性病变，一般预后良好。
首先要观察它是良性的还是恶性的，其实良性和恶性主要的区别就在于良性的主要就是占位性的危害，通俗的讲就是部位长出一个异物，异物就粘在那个位置上，但它不会发生转移，而恶性的病变会发生转移，称作侵袭性生长，皮脂腺囊肿或表皮囊肿是个良性的增生，主要危害就是占位性的危害。
一般情况下，耳朵皮脂腺囊肿，如果患者的病情较轻，可能会自愈；但如果患者的病情较重，通常不会自愈。具体情况分析如下：
有些患者的耳朵皮脂腺囊肿比较小，一般不会持续增大，过一段时间可能会逐渐消失。但是也有一部分患者，如果耳朵上的皮脂腺囊肿比较大或者逐渐增大，需要手术切除。如果囊肿继发感染导致局部肿胀疼痛，需要做囊肿切开引流手术。
一般皮脂腺囊肿不能自行消除。
皮脂腺囊肿不是因为皮脂腺的分泌管堵塞，导致其上皮中的物质不断增加而产生造成的。皮脂腺囊肿可以持续数年而不会出现明显的临床表现，但是也会出现感染、破溃、复发等情况。囊肿壁有分泌作用，可产生内含物质，若不彻底清除，则容易发生反复；当囊腔的内膜腔破溃，里面的物质流出时，很容易引起炎症。皮脂腺囊肿可以通过一些特殊的方法进行彻底的清除或者是彻底的摧毁。
皮脂腺囊肿引流要3一5天。
皮脂腺囊肿可发生于任何年龄，但以青壮年居多。囊肿多因皮脂腺导管阻塞后，腺体内容物聚积而形成，合并感染时一般需要囊肿切开引流，引流需要多长时间需要根据具体的病情情况来决定。一般情况下3-5天就可以了，如果病情比较严重，渗出液较多，可以根据具体情况适当延长时间。
术后需观察切口有无红肿、疼痛、感染等表现，术后有残留的囊肿未消除，遵医嘱随时复查。
皮脂腺囊肿通常属于皮肤科，具体分析如下：
皮脂腺囊肿属于皮肤科的范畴。皮脂腺部位有良性肿物，需要手术切除囊腔，避免复发。但本病多合并细菌感染，皮脂腺部位及周围会出现红肿、按之疼痛、皮温升高等炎症反应。此时可以口服抗菌药物，如阿莫西林胶囊、罗红霉素胶囊等。可以外用夫西地酸软膏或者复方多粘菌素B软膏。治疗期间不能喝酒，也不能吃生蒜、辣椒、生葱、芥末等辛辣刺激性食物。手术后每天都要换药，把切下来的内容物送到病理实验室做病理检查。