自闭症可能是由生理因素形成，如神经机能发展，生化机能发展，遗传因素或脑部受损所致。妇女怀孕期间可能因德国麻疹或风疹，使胎儿的脑部发育受损而导致自闭症。新陈代谢疾病亦会造成脑细胞功能失调，影响脑神经传递信息的功能，因而造成自闭症。还有，在怀孕期间窘迫性流产等因素而造成婴儿大脑发育不全，早产，难产，新生儿脑部受伤，以及在婴儿期患上脑炎，脑膜炎等疾病造成脑部伤害，都可能会增加罹患自闭症的机会。
目前尚无好方法可以完全治好此症，人为去给孩子创造一些条件，让他尽量朝着创造的条件走，如果他有一些刻板或者说有一些非常执着的很单一的兴趣爱好，可以去慢慢改善他，可以通过训练教给他与人沟通的一些技巧和方法，尽量去创造一些与他人交流的机会，让他慢慢去跟正常孩子学会沟通，按时积极的服用药物。
自闭症不是傻子，自闭症和傻子还是有明显的区别的，傻子主要是指智力低下，而自闭症的孩子主要是语言障碍和社会性知识缺乏。自闭症和傻子的区别还在于，自闭症孩子大多数都有良好甚至超常的记忆能力。表现在行为等方面的刻板。这些都是智力低下孩子所没有的，所以自闭症和傻子，是不一样的。
穴位按摩治疗加音乐疗法：在优美的音乐旋律下，使用穴位按摩治疗小儿孤独症，选用四神聪、神庭、本神、头维、情感区等穴位，它着重于调理气血，补肾益智的穴位，取得很好的治疗效果，得到家长们一致认可。中西医结合：以中医理论为基础，结合现代方法，利用分子生物学和现代免疫学的先进技术，中西医结合对自闭症进行综合治疗，提高治疗效果，让自闭症儿童早日走出封闭的空间，回归社会。
一般导致自闭症的原因如下：脑伤：包括在生产过程汇总早产、难产、新生儿脑伤及脑膜炎等多种疾病造成的脑部伤害，这些都有可能增加自闭症的发病率。怀孕期间病毒感染：孩子和妈妈有着密不可分的联系，妈妈在怀孕期间如果受到一些病毒的感染，也会影响到腹中的宝宝。遗传因素：在对所有自闭症患儿的调查中，有20%的自闭症患儿时受遗传因素的影响。
可以去公立的大医院就诊，行为疗法是自闭症教育治疗中最常采用而且有效的方法，主要是应用自闭症儿童本身自发性的反应，来改善自闭症症状及戒除一些重复行为，亦可教导他们以配合日常生活，甚至成为他们的专业技能。
