这种疾病的主要的临床症状就是出现黄疸，往往因生理性的黄疸持续不退，或者退而复现而到医院就诊。其它症状有可能会出现低热、呕吐、腹胀。体检的时候会出现肝脾的肿大，尿的颜色比较深，大便的颜色由黄转变为淡黄，有的人甚至会出现发白。
主要表现为黄疸。往往因生理性黄疸持续不退或退而复现而就诊。其他症状如低热、呕吐、腹胀也会出现。体检有肝脾大，尿色较深，大便由黄转淡黄，亦可发白。多数在3～4个月内黄疸缓慢消退，可并发干眼病，低钙性抽搐、出血及腹泻。少数重症者病程较长可致肝硬化，肝衰竭。
如果新生儿检查提示肝功能损伤，确诊后需要积极护肝治疗。同时还需要进一步检查明确引起肝炎的主要原因，比如急性乙型肝炎，胆汁淤积性肝炎，胆汁胆管畸形等。由于新生儿身体抵抗力相对较差，平时需要加强护理，以免引起感染。简单来说，就是宝宝的生理性黄疸无须担忧，病理性黄疸则要高度重视。
新生儿肝炎与母婴传播有很大的关系。新生儿肝炎大多是宫内病毒感染引起的，也就是母亲通过脐带或胎盘传染给胎儿，出生后立即发病或2个月以后发病。比如巨细胞病毒、单纯疱疹病毒、乙型肝炎病毒、风疹病毒、梅毒等。
一般来说，新生儿肝炎综合征可能是以下几个原因引起的：
1、病毒感染：疱疹病毒、乙肝病毒、巨细胞病毒等病毒病原体可能会诱发新生儿肝炎综合征。
2、细菌感染：李司忒菌、链球菌、大肠埃希菌等细菌病原体也可导致新生儿肝炎综合征。
3、新生儿肝功能障碍：新生儿肝功能障碍，如肝脏内外胆管发育不全、胆汁黏稠等，可能会导致新生儿肝炎综合征。
新生儿肝炎症状有肝内阻塞性黄疸、肝脾肿大、肝功能异常为特征的一种症候群。由于病因较多，对每一病例的确切原因难以确定，故常称为新生儿肝炎综合征。可由甲、乙肝病毒，单纯疱疹病毒，风疹病毒等引起，还有细菌感染所致的中毒性肝炎。