自闭症可能是由生理因素形成，如神经机能发展，生化机能发展，遗传因素或脑部受损所致。妇女怀孕期间可能因德国麻疹或风疹，使胎儿的脑部发育受损而导致自闭症。新陈代谢疾病亦会造成脑细胞功能失调，影响脑神经传递信息的功能，因而造成自闭症。还有，在怀孕期间窘迫性流产等因素而造成婴儿大脑发育不全，早产，难产，新生儿脑部受伤，以及在婴儿期患上脑炎，脑膜炎等疾病造成脑部伤害，都可能会增加罹患自闭症的机会。
一般情况下，小孩自闭症指的是小儿自闭症，其原因尚不清楚。可能与基因、神经系统等有关，具体分析如下：
1、基因：常染色体显著性基因也是导致其发生的原因之一。此外，一些自闭症儿童还出现了一些染色体不正常的情况，其主要特征是：染色体断裂。
2、神经系统：，一些儿童自闭症患者的大脑和大脑的生理和心理都发生了变化；
3、孩子妈妈怀孕时有可能受到某些疾病的影响。
目前，自闭症被认为是一种由各种生理原因造成的普遍的发展失调所造成的一种不正常的表现。
小孩自闭症可以通过药物和非药物方式进行治疗，具体分析如下：首先是药物治疗，目前还没有针对儿童孤独症的临床表现和病情变化的特效药物，药物主要针对用来缓解孤独症、幻觉、妄想等精神症状。在非药疗法中，运用行为分析法和地板时间法是最常见的康复训练和教学方式，是目前国际上普遍接受的一种改善心理疾病和提高社交能力的有效手段。
小孩患自闭症主要表现在社会交往和语言交流障碍、兴趣狭窄、动作行为刻板、智能障碍、精神病性的症状。
社会交往障碍主要表现为不能跟他人建立正常人际交往，不能目光对视，缺乏表情，没有希望和他人拥抱、爱抚的表情姿态，拒绝拥抱和爱抚。语言交流障碍表现为语言发育落后于同龄儿童。兴趣狭窄和行为刻板，对游戏、活动、玩具等不感兴趣，喜欢玩非玩具性物品，如铁丝、车轮、瓶盖等。75%-80%的患者伴有些精神发育迟滞，即智力障碍，有些还有注意缺陷和多动障碍，大概20%有抽动症状。
小孩自闭症可能是遗传、环境、脑部疾病等引起的。自闭症，起病于婴幼儿期，一般在3岁前缓慢起病，主要表现为不同程度的社会交往障碍、语言发育障碍、兴趣狭窄和行为方式刻板，多数患儿还伴有精神发育迟滞。遗传对孤独症有一定的影响，主要是染色特上面的相关基因，会使小孩患自闭症的几率较大；另外，在孕期时有应用药物的病史，接触有害化学物质等，也可能会导致自闭症。同时如果患有脑瘫，可能会使脑功能发育不全，从而引起自闭症。
一般情况下，小孩得了自闭症可以应用小剂量的抗精神病药物，例如氟哌啶醇，以减少患儿的过度活动或者刻板行为等。
还可以进行为治疗或者行为矫治，矫治患儿的缺陷行为，促进其正常发展，以及消除其过分行为，以免干扰正常发展。可以采用奖惩的方法进行矫正。此外还要积极的与孩子交流，带孩子试着接触一些新事物，给予孩子一定的信心。