不可配伍的药物：二性霉素B、青霉素类、头孢菌素类、氯霉素、红霉素、肝素钠、钙制剂、磺胺嘧啶钠和含维生素C的复合维生素B。避免与以下药物联用或相继使用：卡那霉素、新霉素、多黏菌素、巴龙霉素、链霉素、速尿、利尿酸。
脂肪乳和糖尿病之间有着密切的关系。
肥胖患者的脂肪和胰岛素抵抗明显增加。胰岛素抵抗是糖尿病患者糖尿病的重要病理生理环节。如果很多糖尿病患者的血糖控制不理想，就会出现高血糖，体内的脂肪会明显增加。不仅内脏和皮下脂肪丰富，血液中还可发生高脂血症，导致高血糖、高血脂，严重的心脑血管疾病风险也会增加。脂肪也是重要的内分泌器官，分泌许多炎症因子和脂肪因子，是糖尿病患者各种并发症的重要机制之一。在糖尿病的治疗中，会考虑安全降糖，避免低血糖。糖尿病患者还容易出现脂肪肝，糖尿病患者肝脏中的脂肪比例过高，导致肝功能受到影响。同时容易增加肝癌的风险，而且会使糖尿病难以控制，糖尿病严重并发症的风险会明显增加。
脂肪乳的作用可以补充必需脂肪酸，由于疾病原因导致肠道或者不能进食，对脂肪成分吸收功能严重不足，需要额外的补充脂肪酸，补充机体所需。还可以辅助治疗，比如小儿湿疹或者神经衰弱症，动脉粥样硬化等。很多药物属于脂溶性，水剂中溶剂度低或者不溶解可以配合脂肪乳使用，可以补充能量还可以增强溶剂。可以补充人体需要的能量用于胃肠外营养补充必要脂肪酸等，可以预防人体必需脂肪酸缺乏症。
阿莫西林与氨基糖苷类药(如庆大霉素、卡那霉素)、环丙沙星、培氟沙星等药属配伍禁忌。阿莫西林是一种最常用的半合成青霉素类，属于广谱的β-内酰胺类抗生素，为一种白色粉末，所以输液的时候，有一定的配伍禁忌。
本品不宜和抗凝血的药，比如双香豆素，肝素，以及溶栓药同用。抗酸药，比如碳酸氢钠等可以增加本品自尿中的排泄，使血药浓度下降，也是最好不要一起使用。本品和糖皮质激素，如地塞米松等，一起服用，会增加胃肠道不良反应。
硫酸新霉素为氨基糖苷类的抗生素，口服避孕药物长期合用可导致避孕失败，并增加出血的概率。可影响洋地黄、氟尿嘧啶、甲氨蝶呤、维生素a、维生素b12的吸收，使疗效降低。硫酸新霉素不宜与其他肾毒性的药物及耳毒性药物合用。与神经肌肉阻滞药合用时，可增加神经肌肉阻滞的作用，导致骨骼肌软弱等。
