直肠炎的治疗有灌肠，对于粪便硬块嵌顿导致的直肠炎应采取灌肠，解除粪便压迫。由于引发直肠炎的病因较复杂，治疗原则应根据引发直肠炎的病因及疾病采取相应的治疗措施。可以通过粪便、涂片或活检组织进行细菌、真菌和病毒检测；相关抗体及毒素测定。要注意休息和饮食。
对于直肠癌，本事治疗的过程是非常慢的，但是也是可以口服中药治疗或者是灌肠治疗。注意饮食，多喝水，多吃点易消化的食物，可以吃点小米粥，喝点萝卜汤鸡汤，少食多餐，不要暴饮暴食。
导致的直肠炎一些慢性的细菌感染，还有感冒，都有可能迁延，导致发生直肠炎的，另外，如果有痔疮，肛裂，毛囊炎等疾病的人，长期的刺激肛周的皮肤，也会逆行引起直肠炎的。性交不洁，有不洁性交史的人，多个性伴侣，或者是有肛交现象的人，长期的摩擦刺激，也可能会得直肠炎的。
溃疡性直肠炎大多与不良的生活饮食习惯和烟酒刺激有关，恢复较慢，治疗后容易复发。如果有溃疡性直肠炎，就应该清淡饮食，尽量少吃油腻辛辣刺激性食物，不要吸烟与喝酒，多喝水，多吃蔬菜和水果，及时到正规医院检查治疗。
造成直肠炎的原因有，慢性炎症的刺激：长期的慢性炎症可能是引起肛门直肠炎的要素。如慢性细菌感染、阿米巴痢疾、慢性非特异性结肠炎、憩室炎等，使得粘膜发生肉芽肿、炎性变和假息肉阶段而发生炎变。