多发性肾结石可以通过手术进行治疗。感染性肾结石最常见的就是外科治疗，因此，一旦诊断出肾脏结石，要尽可能的进行外科治疗，但是要知道，外科治疗也有一定的适应症，肾结石的病人要知道这一点。对于那些在短时间没有排出的肾脏结石，如果肾脏的直径小于0.8cm，可以考虑用药，但是如果是肾脏的功能比较好，而且不会出现明显的炎症，如果结石的体积大于1cm，建议立即进行外科治疗。
多发性肾结石是比较严重的，多发性肾结石首先要看结石的大小和位置，如果结石很大或者卡在了输尿管等地方是可以造成肾积水的，严重的还会对肾脏功能造成伤害，所以肾结石是需要引起重视的。
双肾多发性肾结石可以通过以下方式进行治疗。
一，结石具体部位结石有多大、结石数量，肾是否正常，根据对以上情况的认识，做出处理上的抉择。如果结石没有位于肾盂和肾盏中，可以不进行治疗，石低于0.5厘米的，应进行排石治疗，结石在0.5~1.5厘米之间时，可用体外震波碎石。当结石大数量较多或者肾功能不佳时，选择手术，体外震波碎石处理是损伤很小的处理手段，把结石震碎，靠尿流排除，治疗痛苦少，通常都可以忍受，一排石需要尿液清洗，需要具备良好肾功能。
日常生活注意，一天的饮水量约为三千毫升，不宜喝果汁，茶和碳酸饮料等，以免含钙过高、限制食盐和糖的高草酸盐膳食。
有多个沉积中心形成并存在，尿中的晶体会不断在这些中心上沉淀，最终形成多发性结石。应该再复查一个腹部超声，查清现在病情的状况，依照检查的结果，对症治疗。饮食要清淡，不要吃豆腐和菠菜，忌烟酒，多喝水，喝完水后要多运动，可以蹦跳，爬楼梯等，这样，都有利于结石的排出。
一般情况下，有多发性肾结石应该注意调整饮食、适当运动等方面，具体内容如下：
1.调整饮食：如果患者患有多发性肾结石，患者应注意调整饮食结构，要做到饮食平衡，要尽量避免吃高嘌呤、高钙、高草酸等食品，以免加重病情。
2.适当运动：患者可以适当进行运动，可以通过跳绳、爬楼梯、跑步等方式来帮助体内的结石排泄。
多发肾结石，通常说明肾脏的结石较多。肾盂内的结石数量大于3个，就可以诊断为多发的肾结石。多发的肾结石通常会引起明显的临床症状，主要表现为腰部疼痛以及血尿等症状。首先还是应该要通过体外震波碎石或者是输尿管镜激光碎石把结石粉碎了以后，再口服排石药物才能够彻底的将多发性的结石排出体外。