一般情况下，治疗肝内钙化灶疾病的方式有以下几种。
1、药物治疗：如果肝内钙化灶患者，出现腹痛、发热、肝区疼痛等症状，应及时到医院就医，并在医生的指导下服用双氯芬酸、阿莫西林等药物进行治疗。
2、手术治疗：如果肝内钙化灶是因结石、肿瘤等原因引起，可能需要通过结石手术、或是肿瘤切除术来进行治疗。
建议患者及时到医院就医，不要拖延病情，以防诱发其他疾病。
肝内钙化灶在肝脏影像学改变中较为常见，亦为较常见肝脏病变之一，通常不是肝炎。
在肝内外胆管系统中发生的结石或狭窄都可以形成肝内钙化灶，但并没有明确区分两者。肝内钙化灶稳定，多数提示过去对肝脏有损害，或具有某些特殊肝脏疾病史。如果在临床上出现了肝功能损害或其他肝实质变化时，都应考虑到肝内钙化病灶的存在，因为这些情况可以导致诊断错误。肝内钙化灶通常无需特别治疗，亦非肝炎之表现。
肝脏的钙化是指肝脏中的某种疾病已经稳定和恢复后的一种病理学变化。由于病灶数量很少，对人体没有任何不良的作用，所以要排除肝内胆管结石等肝内病变，如果确诊为肝内钙化灶，则无需进行治疗的，定期复查即可。
但是，如果确诊为肝内胆管结石，而不是肝内肝化灶，则要进行治疗，尤其是单纯的肝内肝化灶，在处理肝胆管结石的时候，要进行病变的手术。要区别于肝内胆道，以防止误诊。肝内钙化灶不能自行消除，需要明确的是哪些因素引起的，以及引起这种病变的原因，找到病因，及时进行处理。钙化病病史并不需要进行手术，只要病情稳定，就能治愈。
对于肝内钙化灶的患者来说，这种疾病是比较严重的，因为肝上有钙化灶的现象并不罕见，钙化灶只是表现，所以说这种疾病还是比较严重的，通常有一些病变：
第二种是肝内胆管结石，第二种是肝脏的慢性炎症，第二种是寄生虫的感染，第三种是由于胚胎在子宫中出现了肝内钙化灶。如果出现了一些严重的症状，可以通过一些药物来治疗，比如肝功能的异常，比如饮食，喝酒，作息不规律，生活中要注意保持良好的饮食习惯。
肝内钙化灶基本上是不会引起疼痛的，如果疼痛则提示，有可能不是钙化灶或者是肝区有其他疾病引起的。目前如果做B超检查，还需要做一个增强CT或者核磁共振来确定一下问题的，钙化灶主要是因为有炎症或者创伤修复，康复之后留下的疤痕。
肝内的钙化灶，是一种良性的病变，是由于钙质的沉积引起的陈旧性病变，可以化验肝功，病毒DNA定量，如果肝功正常，病毒数量不多，单纯钙化灶是不需要治疗的，这对肝脏功能没有影响，不需要担心，当然，可以定期复查。