弱精畸形精子可以通过手术的方式来进行治疗，当生殖道有感染造成附属生殖腺机能损害时，可以进行先天性精囊缺乏无疗，或者是管阻塞可行手术治疗。还可以通过促性腺激素降低或雄激素减少可行激素替代治疗，生殖道感染行抗感染的治疗方法。
可以治好的。有人在男性不育病人做精液培养，发现溶脲原体阳性者，高达85%。精液中有支原体时，精子活力降低，精子密度减少，畸形精子增多。连服2周，可恢复生育。夫妻间人工授精：用裴尔科密度梯度离心法，可分离出活动力Ⅲ、Ⅳ级，形态正常的精子达90%，后行人工授精。
治疗弱精少精畸形精子症除了药物治疗之外，配合一些富含锌、硒和蛋白质的综合调理，可以促进优质精子的生成，还能改善精子的生长环境。适当增加奶制品、黑豆、黑米的摄入，也需要避免吸烟，喝酒，药物治疗，可以结合中医辨证治疗。
导致弱精子症的原因，第一生殖感染疾病。如附睾、精囊、前列腺有炎症时可引起精浆变异，其酸碱度、供氧、营养、代谢等均不利于精子活动和存活。第二精索静脉曲张。睾丸局部因静脉血液回流障碍而缺氧，另外静脉血中前列腺素及5一羟色胺水平增高，都可引起精子活动力降低。
患有弱精畸形精子症是可以怀孕的，即使病人的精子质量没有达到正常的标准，也有可能使女方怀孕。因为使女方怀孕，只需要一个精子成功的从阴道进入到子宫到输卵管，使卵细胞受孕，就成功了。
畸形精子多可能是长期吸烟和饮酒。还有电子产品的辐射，阴囊温度过高，精索静脉曲张。男性泌尿和生殖系统中的某些感染也是男性精子异常的重要原因。影响精子异常的常见感染包括前列腺炎，精囊炎，尿道炎，睾丸炎和附睾炎。