肾结石治疗后隐隐疼痛难忍可能是正常的现象，也可能是手术切口过大引起的。
由于患者通过手术后，局部麻药时间已过，会出现疼痛现象，一般在手术后24小时疼痛会比较明显，一般会在48小时至72小时后，疼痛可出现明显缓解。这属于正常现象，患者无需采取特殊治疗措施。
除上述原因外，患者出现这种情况，还可能是手术中切口比较大，从而损伤末梢神经所引起的。患者可遵医嘱使用阿司匹林、对乙酰氨基酚、吲哚美辛、双氯芬酸钠等药物进行治疗。
至于肾结石的治疗，要看患者的实际病情和治疗方案。
通常情况下，对于较少的石头，采取一些比较传统的治疗方式，效果会更好。如果采用传统的治疗方式，费用会更低，可以通过排石的方式，达到数百元的效果。一般情况下，体外震波碎石的费用在1000元左右。但如果结石较大，或是阻塞较大，则需采取外科手术，费用也会高一些。通常情况下，微创的手术是最常见的，花费在几万到三万之间。
肾结石治疗方法是使用药物、手术治疗等，具体分析如下：
肾结石的治疗要根据肾结石的大小、数量，有没有并发症等情况而定。如果结石小于5毫米，可以通过喝水和口服排石药物排石。如果肾结石直径6毫米-2厘米，可采用体外冲击波碎石，配合药物排石。如果是石超过2厘米的肾结石或多发肾结石需要微创手术治疗，包括经尿道输尿管软镜下肾结石钬激光碎石，建议积极治疗。
一般情况下，肾结石治疗方案有有以下几种：
1.总体治疗
（1）大量饮水保持尿量超过2000毫升。
（2）调整饮食，避免高盐、高蛋白饮食。草酸钙结石要避免食用高钙、草酸高的食物。
2.去除原发病因素
3.药物治疗：紧急使用药物，改善症状，排石药物，预防结石复发。
4.手术治疗：体外震波碎石，输尿管镜取石，经皮肾切开取石术，开放性手术。
治疗肾结石，最重要的就是注意饮食，预防和控制感冒，避免过度劳累，保持足够的睡眠但是不要饮食而卧和睡前服用刺激性的食物，适当的锻炼。结石直径较大时，应手术进行治疗。
肾结石治疗后还有肾积水通常是肾脏变形造成的，始终会存在部分残留。
肾结石患者在接受治疗前，一般都会出现肾脏水肿，一般都是中度和严重的肾脏水肿。在清除了结石，大部分的肾水肿都会慢慢消失，但也有一部分会留在肾脏里，这是由于肾脏的变形，所以会有一部分的尿留在肾脏里，在进行放射线检查时，就会出现肾水肿的图像。因此，在经过了治疗以后，即使出现了严重的肾脏水肿，也会有一些积水，不过这个面积，绝对要比以前要小得多。