做羊膜腔穿刺术会伤胎儿。做羊膜腔穿刺术有一定的概率会损伤月齐带、胎盘、胎儿偶可发生脐带或胎盘血肿，或刺伤胎儿引起出血。若穿刺出血性羊水，应鉴别来自母体亦或胎儿，注意监测胎心，所以还是不要轻易手术。
一般来说羊膜腔穿刺术是存在风险的，只是风险不大。
首先穿刺的难度是会因人而异的，所以风险也会不同与胎盘的位置、胎儿的体位以及穿刺部位的羊水量有相应的关系。穿刺术是有可能会导致子宫感染或者是流产的情况出现的，所以在进行羊腔膜穿刺术最好选择公立的正规医院，在术后是需要孕妇卧床休息的。在孕期最好是定期的进行孕检，以保证胎儿的正常发育。
彩超主要是通过胎儿的外形来进行筛选。妊娠10-13周，通过彩超对胎儿颈部的透明膜进行检测，以确定唐氏综合症发生的几率。在怀孕15-20周的时候，要根据孕妇的年龄、体重、孕周等因素，来确定胎儿是否存在先天愚型、神经管缺陷的风险。这两个星期的筛选，可以评估患病的危险。如果是高危人群，可以采用无创性DNA或者羊膜腔穿刺等方法进行筛查。
羊膜腔穿刺即羊水穿刺，是在超声引导下精准定位抽取羊水检测的，主要对胎儿染色体的甲胎蛋白、核型分析进行分析，也可进行基因和酶的检测判断某些遗传性疾病。
胎儿脱落的皮肤细胞和胎儿尿液中的肾脏细胞会在羊水中出现，检测人员抽取羊水后，经过培养、染色、离心、读片等处理过程，取得胎儿的染色体核型，另外还会对羊水进行甲胎蛋白检查。羊膜腔穿刺约有1/250~1/300的概率会发生各种风险，意味着每1000次穿刺中有3-4次可能发生危险，检查手段是安全的。羊膜腔穿刺失败一般是因为流产、出血、感染、胎儿损伤、羊水渗漏、子宫肌瘤、子宫畸形、腹壁太厚、羊水量少、胎盘位于子宫前壁等原因或因各种原因导致羊水细胞培养生长不满意或没有生长导致的，无法得出准确结论。
一般情况下，孕妇唐氏筛查需要做，具体内容如下：
唐氏筛检是一种非常有效的预防唐氏儿发生的手段。唐氏儿在新生儿中占有一定的比例，每个人都有唐氏综合症的风险，因此唐氏筛查是必须的。此外，目前医学上尚不能彻底治愈唐氏综合征，因此，防治唐氏综合症的关键是防止或减少新生儿的出生。必须清楚地说，筛查并不是为了确诊某种疾病，而是为了筛选出更有可能得这种病的人。
羊膜腔穿刺术存在感染的风险，羊膜腔穿刺术属于产科侵入性操作，有可能会引起宫腔感染，还存在胎膜早破的风险，进行穿刺术需要穿过羊膜，进入羊膜腔以内，这样会造成羊水外漏，引起胎膜早破。