5厘米的卵巢囊肿，不算是很大。
不过也有可能会发生一些并发症，比如扭转、破裂或者感染等。如果之前没有发现过这种情况，可以在月经干净以后再复查一下B超。如果消失了，说明这是生理性的黄体囊肿，不用治疗。如果囊肿经过彩超检查发现囊肿内有乳头状突起，并且伴有丰富的血流信号，此时行肿瘤标志物检查，发现肿瘤标志物明显升高，考虑囊肿可能有恶变的可能，这时需要行手术干预。
通常情况下，卵巢囊肿61mm的患者可以通过手术治疗、日常护理等方式进行治疗。具体情况分析如下：
1.手术治疗：卵巢囊肿是卵巢内或其表面形成的囊状结构，免疫力下降、感染、吸烟、电离辐射等因素都有可能会导致卵巢囊肿，患者可能会出现坠胀、下腹部不适、月经异常等症状，由于卵巢囊肿61mm的患者使用药物并不能得到较好的治疗效果，患者可以通过卵巢囊肿切除术、附件切除术、子宫切除术等方式进行治疗。
2.日常护理：患者配合医生进行治疗时，平时应注意个人卫生，保持私处的清洁、干燥，早睡早起，还可以适当的进行运动，促进身体恢复的同时，还能提高患者免疫力。
一般卵巢囊肿这种疾病是不会影响排卵的。具体情况分析如下：
卵巢囊肿主要是长期慢性炎症刺激，导致卵巢的腺管堵塞之后，不能很好的分泌液体，从而形成的一种肿块。大部分卵巢囊肿都是良性病变，因此对患者的内分泌影响不大，不会使得患者出现排卵减少，或者是不排卵的情况，但是卵巢囊肿可能会压迫到局部的肌肉组织，引起腹部疼痛，所以建议患者及时治疗。
巧克力囊肿是可以通过妇科检查的方式来判断巧克力囊肿的主要发病部位，对于子宫内膜异位症的病人来讲，是很容易产生触痛感的，巧克力囊肿的直径会小于十厘米左右。可以通过腹腔镜检查。
卵巢巧克力囊肿是一种疾病，具体分析如下：
卵巢巧克力囊肿是因为子宫内膜异位在卵巢深处，经血无法及时排出，从而滞留在卵巢中，形成了一个囊肿，这种囊肿一般都是巧克力糊状，也就是所谓的卵巢巧克力囊肿。卵巢巧克力囊肿是由于子宫内膜异位所致，会出现痛经、月经紊乱等情况，甚至会出现不孕的情况。卵巢巧克力囊肿的治疗方法有两种，一是保守治疗，二是手术，如果病情不是特别严重，可以口服激素类药物。
运用电子声影导航仪，将卵巢及囊肿立体定位，细如发丝的微电极置入囊腔里，吸出囊内积液，再由微电极介入治疗系统将遏制囊肿再生的药物直接介入囊肿处，通过电离作用，使囊肿病灶组织细胞核抑制失活，达到治好囊肿的目的，同时促使卵巢结构和功能恢复正常。