一般情况下，房颤患者心房收缩功能丧失，出现快速颤动的情况。这种快速的颤动，通常会导致心房内的血液流速变慢，使得左心房内的左心耳可能会形成血栓。一方面是因为左心耳是盲端组织，血流速度比较慢，另一方面是因为左心耳里面有很多梳状肌，这些都会增加血栓形成的几率。如果血栓脱落，这些栓子就会随着血液循环到达身体的各个部位。最常见的就是脑部，造成脑栓塞。
一般情况下，在肺动脉血栓病人中，心房颤动的发病率比一般人要高，因此，心房颤动是引起肺动脉血栓的重要原因。具体内容如下：
房颤期患者的血流淤滞，血液流动缓慢，是血流动力学的基本依据。其次，不但能引起血液流速的改变，而且会引起血液中的高凝集。在心室颤动患者中，凝血素浓度显著增高，而抗凝剂浓度则显著降低，而这些都是引起心肌梗塞的主要原因。
患者可以在医生的指导下使用胺碘酮、普罗帕酮、多菲利特、索他洛尔、伊布利特等药物来治疗房颤。同时多吃新鲜的蔬菜和水果。
房颤有可能导致肺栓塞，而房颤是肺栓塞的危险因子。
房颤患者的心房血流是一种非常混乱的旋流，很有可能会出现附壁的血栓。在心房位置，如果有粘连的话，很有可能会掉落到右心室，引起肺栓塞。因此，对于房颤，他的治疗方法之一就是坚持进行抗凝治疗，这不仅可以预防心房中的血栓，还可以预防血栓脱落造成肺栓塞。
因此对于房颤病人，需要进行常规的抗凝治疗，以免发生严重的并发症。
一般来说，引起心源性脑栓塞的原因较多，具体如下。
心源性脑栓塞时栓塞多发生在大脑中动脉，是指来自心脏的栓子阻塞脑中的动脉血管所致。心源性脑栓塞大多发生在有高血压、高血脂或心脏病史的病人之中。一般心房颤动是心源性脑栓塞的常见原因，由于心房颤动时左心房收缩性降低，血流速度减缓，可能导致附壁血栓、栓子等脱落，进而引起脑栓塞。心脏瓣膜病也可能会引起心源性脑栓塞，心脏瓣膜病可能会影响血流，导致附壁血栓的形成，进而引起心源性脑栓塞。心源性脑栓塞还可能是因为心肌梗死，心肌梗死也可能导致血液循环淤滞，促使附壁血栓形成，进而引起心源性脑栓塞。此外，心内膜纤维变性、二尖瓣脱垂、心房黏液瘤、先心病或瓣膜手术都可能引起心源性脑栓塞。
心房颤动可能导致脑渗血。心房颤动的主要临床危险是增加血栓栓塞的风险。与非心房颤动患者相比，脑卒中的发病率和死亡率均有所增加。缺血性中风是死亡率上升的最重要原因。大多数心房颤动栓子来自左心房附件，栓子脱落并随血流进入脑血管，导致脑栓塞。
